Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F05%3A%230000004" target="_blank" >RIV/60109807:_____/05:#0000004 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru
Popis výsledku v původním jazyce
Subtelomerické oblasti se vyznačují relativně vysokým stupněm polymorfismu vzhledem ke zvýšené frekvenci rekombinací v těchto chromozomálních lokusech. Při hledání molekulárních markerů použitelných pro genotypizaci odrůd bramboru se autoři zaměřili na dva možné zdroje polymorfismů vyskytující se v této oblasti: 1. uspořádání bloků subtelomerového chromatinu; 2. struktura rozhraní telomera-subtelomera. S použitím telomerového primeru v kombinaci s některým ze ST3- specifických primerů byly dále amplifikovány a následně klonovány hraniční úseky mezi telomerou a subtelomerou. Výsledkem sekvenční analýzy získaných klonů byla charakterizace nové telomer-asociované sekvence (FIN2). Popsané kombinace sekvenčně-specifických primerů mohou být použity pro rychlou, levnou a reprodukovatelnou genotypizaci vybraných odrůd bramboru.
Název v anglickém jazyce
Structural variability of subtelomeres applied for genotyping of selected potato varieties
Popis výsledku anglicky
Subtelomeric regions reveal a relatively high degree of polymorphism due to the increased frequency of recombination events in these chromosome loci. In a search for molecular markers applicable to genotyping of potato varieties, we focused on two possible sources of polymorphism occurring in this region: (i) arrangement of blocks of subtelomeric chromatin; (ii) structure of telomere-subtelomere boundary. Further, the telomere-subtelomere boundary sequences were amplified using telomeric and ST3-specific primers and the obtained products were cloned. Sequence analysis of the clones resulted in characterisation of a novel telomere-associated sequence (FIN2). The described combinations of sequence-specific primers may be used for the fast, cheap and reproducible PCR-genotyping of selected potato varieties.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GE - Šlechtění rostlin
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2005
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Czech Journal of Genetics and Plant Breeding
ISSN
ISSN1212-1975
e-ISSN
—
Svazek periodika
41
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
6
Strana od-do
17-22
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—