Alternativní metody a postupy laboratorní diagnózy Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus.
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F15%3A%230000333" target="_blank" >RIV/60109807:_____/15:#0000333 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Alternativní metody a postupy laboratorní diagnózy Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus.
Popis výsledku v původním jazyce
Práce přináší podrobný popis čtyř metod laboratorní diagnózy Cms, které doplňují stávající postupy a metody doporučené pro skreeningovou kontrolu tohoto patogena. Jsou zahrnuty postupy extrakce jak z hlíz, tak rostlin bramboru a izolace DNA pomocí preparačních kolonek. Z vlastních diagnostických metod jsou detailně uvedeny optimalizované postupy pro DAS ELISA (dva původy protilátek) a postup detekce pomocí technologie Luminex xMAP. Z molekulárních metod jsou detailně popsány postupy práce s komerční soupravou pro konvenční PCR a dva postupy qPCR. Spolehlivost detekce pomocí všech postupů jednotlivě a při jejich srovnání je demonstrována na záznamech výsledků u souboru zdravých a infikovaných vzorků, souběžně diagnostikovaných standardní imunofluorescenční (IF) metodou. Nejvyšší citlivost (řádově až do ředění extraktů 103 ) byla prokázána u metody qPCR, doplněné kontrolou kvality izolované DNA interním markerem. Doporučujeme výběrové využití metod jak pro doplnění oficiální skreeningové kontroly sadbových materiálů, tak pro diagnostické laboratoře šlechtitelských a množitelských organizací disponující nezbytným vybavením.
Název v anglickém jazyce
Alternative methods and procedures for Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus diagnosis
Popis výsledku anglicky
The publication provides detailed description of four additional laboratory diagnosis methods of Cms completing existing methods and procedures recommended for screening. The suitable procedure of sap extractions from tubers as well as from potato plants and isolation of DNA using separative columns are included. From serological diagnostic methods are presented optimized procedures of DAS ELISA, utilizing two sources of antibodies and Luminex xMAP technology. From molecular methods are in detail described conventional PCR using commercial diagnostic kit and two procedures of qPCR. Reliability of detection using all the new methods was compared on standard samples and with the procedure if IF assays.
Klasifikace
Druh
N<sub>metC</sub> - Metodiky certifikované oprávněným orgánem
CEP obor
GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
ISBN 978-80-86940-68-7
Číslo předpisu
6700/2016-MZe-17221
Technické parametry
Smlouva o uplatnění certifikované metodiky. Uživatel: Vesa Velhartice, a.s., IČ:46884335, 31.12.2015. Ing. Viktor Kopačka, Vesa Velhartice a.s. 34142 Velhartice, tel.: +420 602186423
Ekonomické parametry
Zvýšení spolehlivosti diagnózy závažného karanténího onemocnění s nulovou tolerancí výskytu.
Označení certifikačního orgánu
Ministerstvo zemědělství ČR
Datum certifikace
—
Způsoby využití výsledku
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů