Možnosti detekce a kvantifikace Rhizoctonia solani v půdě
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F23%3AN0000054" target="_blank" >RIV/60109807:_____/23:N0000054 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/62156489:43210/23:43924205
Výsledek na webu
<a href="http://www.mendelu.cz" target="_blank" >http://www.mendelu.cz</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Možnosti detekce a kvantifikace Rhizoctonia solani v půdě
Popis výsledku v původním jazyce
Cílem této práce bylo optimalizovat metodu qPCR pro kvantifikaci R. solani v půdě. Hodnocení bylo provedeno u vzorků odebraných ze 3 stanovišť S1, S2 a S3. Pro ověření účinnosti izolace DNA a následné kvantifikace pomocí qPCR byla část vzorku půdy S1 kontaminován myceliem R.solani. Kalibrace byla provedena pomocí DNA izolované z mycelia tohoto patogenu. DNA ze vzorků půdy byla izolována pomocí kitu AllPrep® PoverFecal®DNA/RNA Kit a pro kvantifikaci byla optimalizována metoda relativní kvantifikace. Výsledky byly vyjádřeny poměrem k vybranému vzorku kalibrační křivky, který odpovídal koncentraci DNA 0,5 ngμl-1. Ve dvou vzorcích půdy byla prokázána DNA R solani na úrovni asi 1000x nižší oproti vnitřnímu kalibrátoru.
Název v anglickém jazyce
Possibilities of detection and quantification of Rhizoctonia solani in soil
Popis výsledku anglicky
The aim of this work was to optimize the qPCR method for quantification of R. solani in soil. The evaluation was carried out on samples taken from three localities S1, S2 and S3. To verify the efficiency of DNA isolation and subsequent quantification by qPCR, part of the soil sample S1 was contaminated with R. solani mycelia. Calibration was performed using DNA isolated from the mycelium of this pathogen. DNA from soil samples was isolated using the AllPrep® PoverFecal®DNA/RNA Kit and evaluation of the R. solani specific DNA level was done by the relative quantification method. The results were expressed as a ratio to the selected sample of the calibration curve, which corresponded to a DNA concentration of 0.5 ngμl-1. In two soil samples, R. solani DNA was detected at the level about 1000x lower than the internal calibrator.
Klasifikace
Druh
J<sub>ost</sub> - Ostatní články v recenzovaných periodicích
CEP obor
—
OECD FORD obor
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/QK21010083" target="_blank" >QK21010083: Ekologická ochrana konzumních brambor jako zdravé zeleniny proti vybraným půdou a sadbou přenášeným patogenům</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2023
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Úroda
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Svazek periodika
70
Číslo periodika v rámci svazku
12
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
93-100
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—