Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Cross-species proteomic comparison of outer membrane vesicles and membranes of Francisella tularensis subsp. tularensis versus subsp. holarctica

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60162694%3AG44__%2F21%3A00556705" target="_blank" >RIV/60162694:G44__/21:00556705 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jproteome.0c00917" target="_blank" >https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jproteome.0c00917</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.0c00917" target="_blank" >10.1021/acs.jproteome.0c00917</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Cross-species proteomic comparison of outer membrane vesicles and membranes of Francisella tularensis subsp. tularensis versus subsp. holarctica

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Release of outer membrane vesicles (OMV) is an important phenomenon in Gram-negative bacteria playing multiple roles in their lifestyle, including in relation to virulence and host–pathogen interaction. Francisella tularensis, unlike other bacteria, releases unusually shaped, tubular OMV. We present a proteomic comparison of OMV and membrane fractions from two F. tularensis strains: moderately virulent subsp. holarctica strain FSC200 and highly virulent subsp. tularensis strain SchuS4. Proteomic comparison studies routinely evaluate samples from the same proteome, but sometimes we must compare samples from closely related organisms. This raises quantification issues. We propose a novel approach to cross-species proteomic comparison based on an intersection protein database from the individual single-species databases. This is less prone to quantification errors arising from differences in the sequences. Consecutively comparing subproteomes of OMV and membranes of the two strains allows distinguishing differences in relative protein amounts caused by global expression changes from those caused by preferential protein packing to OMV or membranes. Among the proteins most differently packed into OMV between the two strains, we detected proteins involved in biosynthesis and metabolism of bacterial envelope components like O-antigen, lipid A, phospholipids, and fatty acids, as well as some major structural outer membrane proteins. The data are available via ProteomeXchange with identifier PXD022406.

  • Název v anglickém jazyce

    Cross-species proteomic comparison of outer membrane vesicles and membranes of Francisella tularensis subsp. tularensis versus subsp. holarctica

  • Popis výsledku anglicky

    Release of outer membrane vesicles (OMV) is an important phenomenon in Gram-negative bacteria playing multiple roles in their lifestyle, including in relation to virulence and host–pathogen interaction. Francisella tularensis, unlike other bacteria, releases unusually shaped, tubular OMV. We present a proteomic comparison of OMV and membrane fractions from two F. tularensis strains: moderately virulent subsp. holarctica strain FSC200 and highly virulent subsp. tularensis strain SchuS4. Proteomic comparison studies routinely evaluate samples from the same proteome, but sometimes we must compare samples from closely related organisms. This raises quantification issues. We propose a novel approach to cross-species proteomic comparison based on an intersection protein database from the individual single-species databases. This is less prone to quantification errors arising from differences in the sequences. Consecutively comparing subproteomes of OMV and membranes of the two strains allows distinguishing differences in relative protein amounts caused by global expression changes from those caused by preferential protein packing to OMV or membranes. Among the proteins most differently packed into OMV between the two strains, we detected proteins involved in biosynthesis and metabolism of bacterial envelope components like O-antigen, lipid A, phospholipids, and fatty acids, as well as some major structural outer membrane proteins. The data are available via ProteomeXchange with identifier PXD022406.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10609 - Biochemical research methods

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA17-04010S" target="_blank" >GA17-04010S: Studium sekrece vnějších membránových vezikul u mikroba Francisella tularensis a jejich úlohy v interakci s hostitelem</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Proteome Research

  • ISSN

    1535-3893

  • e-ISSN

    1535-3907

  • Svazek periodika

    20

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    17

  • Strana od-do

    1716-1732

  • Kód UT WoS článku

    000626877900022

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85101941287