NOVÝ PCR MARKER PRO RYCHLOU A SPOLEHLIVOU DETEKCI GENU R1 REZISTENCE BRAMBORU VŮČI PHYTOPHTHORA INFESTANS

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60460709%3A41210%2F05%3A%23%23%2312802" target="_blank" >RIV/60460709:41210/05:###12802 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

NOVÝ PCR MARKER PRO RYCHLOU A SPOLEHLIVOU DETEKCI GENU R1 REZISTENCE BRAMBORU VŮČI PHYTOPHTHORA INFESTANS

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem předkládané publikace bylo ověřit hypotézu existence dosud nepublikovaných funkčních homologů R1 genu, který řídí specifickou rezistenci bramboru vůči plísni bramboru, se stejným nebo podobným fenotypem jako R1 gen. Pro tyto účely byl navržen prostřednictvím nástrojů bioinformatiky specifický PCR marker R1M3 na 3´ konec třetího exonu R1 genu. Marker R1M3 byl testován společně s dříve publikovaným markerem R1M1 na kolekci 103 odrůd brambor, kde 45 genotypů mělo fenotypově deklarovanou přítomnost genu R1. Výsledky amplifikace obou markerů v rámci testovaného souboru odrůd byly naprosto identické. Přesto, že u 12 ze 45 odrůd s deklarovanou přítomností fenotypu R1 nedošlo k amplifikaci obou specifických markerů nebyla potvrzena hypotéza o existenci neznámého homologu R1 genu. Spolehlivost amplifikace markeru R1M3 umožňuje jeho rutinní využití v procesu (MAS) bramboru na rezistenci vůči plísni bramboru.

Název v anglickém jazyce

DEVELOPMENT OF NEW PCR MARKER FOR FAST AND RELIABLE DETECTION OF POTATO R1 GENE, WHICH CONFERS RESISTANCE AGAINST LATE BLIGHT

Popis výsledku anglicky

The aim of this work was to test possibility that potato R1 gene, which confers resistance against Late Blight, is present in potato genome in more sequentialy different copies expressing similar or the same phenotype. To check out this possibility we used bioinformatic tools for development of specific R1M3 marker. This marker is designated to amplify 3´ end of R1 gen third exon. We amplified R1M3 in common with R1M1, which was published earlier for detection of R1 gene, on set of 103 potato variets. According to public databases 45 potato clones from this set express R1 phenotype. Results of amplification were identical for both markers among all 103 genotypes tested. 12 clones which express R1 phenotype showed no amplification of either specific markers. In face of those results we did not prove hypothesis about R1 gene functional homologues. Nevertheless the amplification reliability of R1M3 makes it grate candidate for routine application in MAS of potato against Late Blight.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GE - Šlechtění rostlin

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QF4107" target="_blank" >QF4107: Vývoj metod identifikace a charakterizace donorů rezistence plísně bramborové v genofondu bramboru pomocí DNA markerů a biologického testu v in vitro podmínkách</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

MendelNet05 Agro

ISBN

80-7157-905-X

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

30-30

Název nakladatele

MZLU v Brně

Místo vydání

BRNO

Místo konání akce

Agronomická fakulta MZLU v Brně

Datum konání akce

29. 11. 2005

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—