STUDIUM VARIABILITY NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTÍ MITOCHONDRIÁLNÍ DNA U VYBRANÝCH GENOVÝCH ZDROJŮ RODU SOLANUM

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60460709%3A41210%2F11%3A51431" target="_blank" >RIV/60460709:41210/11:51431 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

STUDIUM VARIABILITY NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTÍ MITOCHONDRIÁLNÍ DNA U VYBRANÝCH GENOVÝCH ZDROJŮ RODU SOLANUM

Popis výsledku v původním jazyce

Kódující oblasti v mitochondriálním genomu jsou vysoce konzervativní mezi druhy i rody. Nicméně sekvence intronů a oblastí mezi geny jsou vysoce variabilní, protože neobsahují sekvence nezbytné pro funkci organel. Bylo zhodnoceno celkem 145 genotypů náležících k 16 druhům rodu Solanum. Analýzou markeru nad2/4/nad2/5 nebyl detekován polymorfismus. Dále byly použity pár mt primerů atp9/atp9 a pár primerů rrn5/rrn18-1. Analýzou na horizontálním agarózovém gelu, metodou SSCP a DGGE nebyl detekován polymorfismus. Posledním použitým markerem byl cox1/cox1. Restrikčním štěpením fragmentu enzymem Hinf1 byla detekována variabilita pouze u druhu S. mochiquense. Ze sekvenování fragmentu atp9/atp9 vyplývá, že tento intergenový mezerník vykazuje mezi druhy různýchčeledí relativně nízkou variabilitu, z čehož lze usuzovat na vysokou míru konzervovanosti napříč rostlinnou říší. Získané výsledky potvrzují hypotézu, že mitochondriální DNA vykazuje obecně nízkou variabilitu.

Název v anglickém jazyce

STUDY OF MITOCHONDRIAL DNA NON-CODING REGIONS VARIABILITY IN SELECTED GENE RESOURCES OF GENUS SOLANUM

Popis výsledku anglicky

Coding regions of the mitochondrial genome are highly conservative among species and genera. However, the sequences of introns and regions between genes can be highly variable, because they do not contain sequences necessary for the function of organelles. There were evaluated a total of 145 genotypes belonging to 16 species of the genus Solanum. No polymorphism was detected by analysis of nad2/4/nad2/5. There were also used primer pair for mt atp9/atp9 intron and the pair of primers rrn5/rrn18-1 intergenic spacer. Analysis on a horizontal agarose gel, using SSCP and DGGE detected no polymorphism. The last used marker mapped cox1/cox1 intron. There was detected fragment variability only in the species S. mochiquense by using restriction enzyme Hinf1. The sequencing of the fragment atp9/atp9 results, that this intergenic spacer shows relatively low variability among the species of different families, which suggest a high conservation degree across the plant kingdom.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

GE - Šlechtění rostlin

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Vědecké práce

ISSN

1802-940X

e-ISSN

—

Svazek periodika

18

Číslo periodika v rámci svazku

—

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

53-62

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—