Phylogenomic analysis of 589 metagenome-assembled genomes encompassing all major prokaryotic lineages from the gut of higher termites
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60460709%3A41320%2F20%3A84413" target="_blank" >RIV/60460709:41320/20:84413 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://peerj.com/articles/8614/" target="_blank" >https://peerj.com/articles/8614/</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.7717/peerj.8614" target="_blank" >10.7717/peerj.8614</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Phylogenomic analysis of 589 metagenome-assembled genomes encompassing all major prokaryotic lineages from the gut of higher termites
Popis výsledku v původním jazyce
Higher termites have been able to colonize all tropical and subtropical regions because of their ability to digest lignocellulose with the aid of their prokaryotic gut microbiota. Over the last decade, numerous studies based on 16S rRNA gene amplicon libraries have largely described both the taxonomy and structure of the prokaryotic communities associated with termite guts. Host diet and microenvironmental conditions have emerged as the main factors structuring the microbial assemblages in the different gut compartments. Additionally, these molecular inventories have revealed the existence of termite-specific clusters that indicate coevolutionary processes in numerous prokaryotic lineages. However, for lack of representative isolates, the functional role of most lineages remains unclear. We reconstructed 589 metagenome-assembled genomes (MAGs) from the different gut compartments of eight higher termite species that encompass 17 prokaryotic phyla. By iteratively building genome trees for each clade, w
Název v anglickém jazyce
Phylogenomic analysis of 589 metagenome-assembled genomes encompassing all major prokaryotic lineages from the gut of higher termites
Popis výsledku anglicky
Higher termites have been able to colonize all tropical and subtropical regions because of their ability to digest lignocellulose with the aid of their prokaryotic gut microbiota. Over the last decade, numerous studies based on 16S rRNA gene amplicon libraries have largely described both the taxonomy and structure of the prokaryotic communities associated with termite guts. Host diet and microenvironmental conditions have emerged as the main factors structuring the microbial assemblages in the different gut compartments. Additionally, these molecular inventories have revealed the existence of termite-specific clusters that indicate coevolutionary processes in numerous prokaryotic lineages. However, for lack of representative isolates, the functional role of most lineages remains unclear. We reconstructed 589 metagenome-assembled genomes (MAGs) from the different gut compartments of eight higher termite species that encompass 17 prokaryotic phyla. By iteratively building genome trees for each clade, w
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10606 - Microbiology
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/EF16_019%2F0000803" target="_blank" >EF16_019/0000803: Excelentní Výzkum jako podpora Adaptace lesnictví a dřevařství na globální změnu a 4. průmyslovou revoluci</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
PeerJ
ISSN
2167-8359
e-ISSN
—
Svazek periodika
8
Číslo periodika v rámci svazku
e8614
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
27
Strana od-do
1-27
Kód UT WoS článku
000513179700011
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85079656457