Optimalizace postupu analýzy FISH pro identifikaci a kvantifikaci bakterií v aktivovaném kalu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22320%2F14%3A43897091" target="_blank" >RIV/60461373:22320/14:43897091 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Optimalizace postupu analýzy FISH pro identifikaci a kvantifikaci bakterií v aktivovaném kalu

Popis výsledku v původním jazyce

Fluorescenční in situ hybridizace (FISH) je metoda molekulární biologie, která je využívána pro detekci bakterií (říše, rod, druh) v aktivovaném kalu na základě znalosti specifických sekvencí v jejich nukleových kyselinách, s využitím fluorescenčně označených genových sond. Prvním a zásadním krokem celé analýzy je fixace vzorků. Existuje několik různých postupů pro fixaci vzorků, proto je první část tohoto experimentu zaměřena na nalezení metody optimální. Jako optimální postup fixace byl vyhodnocen postup, při kterém bylo detekováno nejvyšší procento cílových bakterií v jednom vzorku aktivovaného kalu. Vliv použité sušiny aktivovaného kalu na výsledky kvantifikace byl sledován v další části experimentu. Cílem bylo vyzkoušet, zda použitá sušina ovlivňuje hodnoty získané kvantifikací a zda jsou výsledky dvou vzorků s různou sušinou porovnatelné. Bylo tedy zjištěno, zda je potřeba sušinu kalu před analýzou upravovat, či nikoliv. Posledním diskutabilním krokem analýzy FISH je její konečná

Název v anglickém jazyce

Optimization of FISH analysis for the identification and quantification of bacteria in activated sludge

Popis výsledku anglicky

Fluorescence in situ hybridization (FISH) is a molecular biology method used for the detection of bacteria (phylum, genus, species) in activated sludge based on knowledge of their specific sequences in nucleic acids using fluorescently labeled gene probes. The first and essential step is to fix samples. There are several different techniques of fixation, so the first part of this experiment is focused on finding the optimum method. As the optimal fixation procedure was evaluated the one in which the highest percentage of target bacteria in the same sample of activated sludge was detected. Effect of activated sludge solids to the results of quantification was observed in the next part of the experiment. The aim was to test whether used solids affects the values obtained by quantification and whether the results of two samples with different solids are comparable. It was thus found that the solids of the sludge is needed to modify before analysis or not. Another questionable step of FISH

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

DJ - Znečištění a kontrola vody

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/FR-TI4%2F254" target="_blank" >FR-TI4/254: Kontejnerová technologie pro čištění průmyslových odpadních vod</a><br>

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Vodárenská biologie 2014

ISBN

978-80-86832-78-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

114-119

Název nakladatele

Vodní zdroje Ekomonitor s.r.o.

Místo vydání

Chrudim

Místo konání akce

Praha

Datum konání akce

5. 2. 2014

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—