Použití bioinformatiky v rostlinné biologii-analýza proteinových sekvencí
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F03%3A00008887" target="_blank" >RIV/60461373:22330/03:00008887 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Použití bioinformatiky v rostlinné biologii-analýza proteinových sekvencí
Popis výsledku v původním jazyce
Dokončení kompletní geonomové sekvence modelových rostlinných organismů jako Arabidopsis thaliana či rýže, a exponenciální nárůst probíhajících i dokončených sekvenačních projektů, přinášející ohromné množství primárních sekvenčních dat, vyžaduje nové postupy a prostředky k jejich zpracování. Zde se pokusím nastínit nejpoužívanější strategie analýzy proteinových sekvencí a možnosti jejich využití pro biologii rostlin. Text je členěn podle pravděpodobného schématu práce a zahrnuje identifikaci homologních proteinů, možnosti analýzy primární sekvence a predikci sekundární a terciární struktury proteinů. Ve výčtu příslušných programů se omezím pouze na software a služby dostupné přes internet, které jsou v akademické sféře volně distribuovatelné.
Název v anglickém jazyce
Bioinformatics in plant biology - implications in protein sequence analysis
Popis výsledku anglicky
The availability of complete genomic sequences of model plants Arabidopsis thaliana and rice and number of other running or completed genome projects results in exponential growth of publicly available primary sequence data. This growth demands development and use of novel methodical approaches and tools for sequence analysis. Here I summarize both strategies used in bioinformatic analysis of protein sequences and their use in plant biology. Freely available tools for homology searches, primary and secondary structure analysis and homology modeling are described and discussed.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2003
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Biologické listy
ISSN
0366-486
e-ISSN
—
Svazek periodika
68
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
239-246
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—