Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization (MALDI)-Time of Flight Mass Spectrometry- and MALDI Biotyper-based identification of cultured biphenyl-metabolizing bacteria from contaminated horseradish rhizosphere soil

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F11%3A43891573" target="_blank" >RIV/60461373:22330/11:43891573 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68378050:_____/11:00368927 RIV/61388963:_____/11:00368927

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1128/AEM.05465-11" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1128/AEM.05465-11</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1128/AEM.05465-11" target="_blank" >10.1128/AEM.05465-11</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization (MALDI)-Time of Flight Mass Spectrometry- and MALDI Biotyper-based identification of cultured biphenyl-metabolizing bacteria from contaminated horseradish rhizosphere soil

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Bacteria that are able to utilize biphenyl as a sole source of carbon were extracted and isolated from polychlorinated biphenyl (PCB)-contaminated soil vegetated by horseradish. Isolates were identified using matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). The usage of MALDI Biotyper for the classification of isolates was evaluated and compared to 16S rRNA gene sequence analysis. A wide spectrum of bacteria was isolated, with Arthrobacter, Serratia, Rhodococcus, and Rhizobium being predominant. Arthrobacter isolates also represented the most diverse group. The use of MALDI Biotyper in many cases permitted the identification at the level of species, which was not achieved by 16S rRNA gene sequence analyses. However, some isolates had to be identified by 16S rRNA gene analyses if MALDI Biotyper-based identification was at the level of probable or not reliable identification, usually due to a lack of reference spectra included in the database.

  • Název v anglickém jazyce

    Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization (MALDI)-Time of Flight Mass Spectrometry- and MALDI Biotyper-based identification of cultured biphenyl-metabolizing bacteria from contaminated horseradish rhizosphere soil

  • Popis výsledku anglicky

    Bacteria that are able to utilize biphenyl as a sole source of carbon were extracted and isolated from polychlorinated biphenyl (PCB)-contaminated soil vegetated by horseradish. Isolates were identified using matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). The usage of MALDI Biotyper for the classification of isolates was evaluated and compared to 16S rRNA gene sequence analysis. A wide spectrum of bacteria was isolated, with Arthrobacter, Serratia, Rhodococcus, and Rhizobium being predominant. Arthrobacter isolates also represented the most diverse group. The use of MALDI Biotyper in many cases permitted the identification at the level of species, which was not achieved by 16S rRNA gene sequence analyses. However, some isolates had to be identified by 16S rRNA gene analyses if MALDI Biotyper-based identification was at the level of probable or not reliable identification, usually due to a lack of reference spectra included in the database.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EE - Mikrobiologie, virologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2011

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Applied and Environmental Microbiology

  • ISSN

    0099-2240

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    77

  • Číslo periodika v rámci svazku

    19

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    6858-6866

  • Kód UT WoS článku

    000295123300016

  • EID výsledku v databázi Scopus