Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Protein Stability in TMAO and Mixed Urea-TMAO Solutions

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22340%2F20%3A43920571" target="_blank" >RIV/60461373:22340/20:43920571 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.0c04357" target="_blank" >https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.0c04357</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c04357" target="_blank" >10.1021/acs.jpcb.0c04357</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Protein Stability in TMAO and Mixed Urea-TMAO Solutions

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Osmolytes are essential for cellular function under ubiquitous osmotic stress. Trimethylamine N-oxide (TMAO) is one such osmolyte that has gained remarkable attention due to its protein-protective ability against urea. This Review aims at providing a detailed account of recent theoretical and experimental developments in characterizing the structural changes and thermodynamic stability of proteins in the presence of TMAO and urea. New vapor pressure osmometry and molecular dynamics simulation results on urea–TMAO solutions are presented, and a unified molecular mechanism of TMAO counteraction of urea-induced protein denaturation is introduced. In addition, a detailed technical assessment of molecular dynamics force fields for TMAO and for urea–TMAO solutions is presented. The force field analysis highlights how many of the commonly used force field models are in fact incompatible with solvation thermodynamics and can lead to misleading conclusions. A new optimized force field for TMAO (Shea(m)) is presented, and a recently optimized force field for TMAO–urea (Netz(m)) that best reproduces experimental data is highlighted.

  • Název v anglickém jazyce

    Protein Stability in TMAO and Mixed Urea-TMAO Solutions

  • Popis výsledku anglicky

    Osmolytes are essential for cellular function under ubiquitous osmotic stress. Trimethylamine N-oxide (TMAO) is one such osmolyte that has gained remarkable attention due to its protein-protective ability against urea. This Review aims at providing a detailed account of recent theoretical and experimental developments in characterizing the structural changes and thermodynamic stability of proteins in the presence of TMAO and urea. New vapor pressure osmometry and molecular dynamics simulation results on urea–TMAO solutions are presented, and a unified molecular mechanism of TMAO counteraction of urea-induced protein denaturation is introduced. In addition, a detailed technical assessment of molecular dynamics force fields for TMAO and for urea–TMAO solutions is presented. The force field analysis highlights how many of the commonly used force field models are in fact incompatible with solvation thermodynamics and can lead to misleading conclusions. A new optimized force field for TMAO (Shea(m)) is presented, and a recently optimized force field for TMAO–urea (Netz(m)) that best reproduces experimental data is highlighted.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10403 - Physical chemistry

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA20-24155S" target="_blank" >GA20-24155S: Studium preferenčních interakcí, přemosťování, a efektu kononsolvence na polymer PNIPAM pomocí experimentální a výpočetní termodynamiky</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Physical Chemistry B

  • ISSN

    1520-6106

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    124

  • Číslo periodika v rámci svazku

    29

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    17

  • Strana od-do

    "6181–6197"

  • Kód UT WoS článku

    000555505200001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85088607484