Structure, Energetics, Vibrational Frequencies and Charge Transfer of Base Pairs, Nucleoside Pairs, Nucleotide Pairs and B-DNA Pairs of Trinucleotides: ab initio HF/MINI-1 and Empirical Force Field Study.

Kód výsledku v IS VaVaI

RIV/61388955:_____/00:54000101 - isvavai.cz

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Structure, Energetics, Vibrational Frequencies and Charge Transfer of Base Pairs, Nucleoside Pairs, Nucleotide Pairs and B-DNA Pairs of Trinucleotides: ab initio HF/MINI-1 and Empirical Force Field Study.

Popis výsledku v původním jazyce

Geometries, interaction energies and vibrational frequencies of base pairs, nucleoside pairs and nucleotide pairs were studied by ab initio method and empirical AMBER 4.1 force field.A good agreement was found between HF/MINI-1 and AMBER results. Stabilization energies of clusters are lowered when passing from base pairs to nucleoside, nucleotide pairs and to pairs of trinucleotides. The lowest vibrations of base pairs and nucleoside pairs correspond to intermolecular motions of bases.

Název v anglickém jazyce

Structure, Energetics, Vibrational Frequencies and Charge Transfer of Base Pairs, Nucleoside Pairs, Nucleotide Pairs and B-DNA Pairs of Trinucleotides: ab initio HF/MINI-1 and Empirical Force Field Study.

Popis výsledku anglicky

Geometries, interaction energies and vibrational frequencies of base pairs, nucleoside pairs and nucleotide pairs were studied by ab initio method and empirical AMBER 4.1 force field.A good agreement was found between HF/MINI-1 and AMBER results. Stabilization energies of clusters are lowered when passing from base pairs to nucleoside, nucleotide pairs and to pairs of trinucleotides. The lowest vibrations of base pairs and nucleoside pairs correspond to intermolecular motions of bases.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

GA203/97/0029: Struktura a dynamika DNA

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2000

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Biomolecular Structure & Dynamics

ISSN

0739-1102

e-ISSN

—

Svazek periodika

17

Číslo periodika v rámci svazku

6

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—