The differential interaction of snRNPs with pre-mRNA reveals splicing kinetics in living cells
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388955%3A_____%2F10%3A00351126" target="_blank" >RIV/61388955:_____/10:00351126 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68378050:_____/10:00351126
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
The differential interaction of snRNPs with pre-mRNA reveals splicing kinetics in living cells
Popis výsledku v původním jazyce
Precursor messenger RNA (pre-mRNA) splicing is catalyzed by the spliceosome, a large ribonucleoprotein (RNP) complex composed of five small nuclear RNP particles (snRNPs) and additional proteins. Using live cell imaging of GFP-tagged snRNP components expressed at endogenous levels, we examined how the spliceosome assembles in vivo. A comprehensive analysis of snRNP dynamics in the cell nucleus enabled us to determine snRNP diffusion throughout the nucleoplasm as well as the interaction rates of individual snRNPs with pre-mRNA. Core components of the spliceosome, U2 and U5 snRNPs, associated with pre-mRNA for 15-30 s, indicating that splicing is accomplished within this time period. Additionally, binding of U1 and U4/U6 snRNPs with pre-mRNA occurred within seconds, indicating that the interaction of individual snRNPs with pre-mRNA is distinct.
Název v anglickém jazyce
The differential interaction of snRNPs with pre-mRNA reveals splicing kinetics in living cells
Popis výsledku anglicky
Precursor messenger RNA (pre-mRNA) splicing is catalyzed by the spliceosome, a large ribonucleoprotein (RNP) complex composed of five small nuclear RNP particles (snRNPs) and additional proteins. Using live cell imaging of GFP-tagged snRNP components expressed at endogenous levels, we examined how the spliceosome assembles in vivo. A comprehensive analysis of snRNP dynamics in the cell nucleus enabled us to determine snRNP diffusion throughout the nucleoplasm as well as the interaction rates of individual snRNPs with pre-mRNA. Core components of the spliceosome, U2 and U5 snRNPs, associated with pre-mRNA for 15-30 s, indicating that splicing is accomplished within this time period. Additionally, binding of U1 and U4/U6 snRNPs with pre-mRNA occurred within seconds, indicating that the interaction of individual snRNPs with pre-mRNA is distinct.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Cell Biology
ISSN
0021-9525
e-ISSN
—
Svazek periodika
191
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
12
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000282648500009
EID výsledku v databázi Scopus
—