GPU-Based Massive Parallel Kawasaki Kinetics in the Dynamic Monte Carlo Simulations of Lipid Nanodomains
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388955%3A_____%2F12%3A00384415" target="_blank" >RIV/61388955:_____/12:00384415 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/ct300587w" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1021/ct300587w</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/ct300587w" target="_blank" >10.1021/ct300587w</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
GPU-Based Massive Parallel Kawasaki Kinetics in the Dynamic Monte Carlo Simulations of Lipid Nanodomains
Popis výsledku v původním jazyce
Multicomponent lipid membranes in the liquid phase exhibit dynamic lateral heterogeneities which play an important role in specific cell membrane functions. A GPU-based parallel algorithm for two-dimensional lattice Dynamic Monte Carlo simulations of nanodomain formation in binary lipid membranes was developed and tested. Speedups of up to 50-times over CPU-based calculations were achieved, and simulations employing lattices of up to 1800 1800 sites were performed. The existence of large nonregular lipid domains of sizes up to 160 nm was demonstrated. This reveals the necessity to employ lattices of at least 900 900 sites to study the lateral lipid organization in complex lipid membranes.
Název v anglickém jazyce
GPU-Based Massive Parallel Kawasaki Kinetics in the Dynamic Monte Carlo Simulations of Lipid Nanodomains
Popis výsledku anglicky
Multicomponent lipid membranes in the liquid phase exhibit dynamic lateral heterogeneities which play an important role in specific cell membrane functions. A GPU-based parallel algorithm for two-dimensional lattice Dynamic Monte Carlo simulations of nanodomain formation in binary lipid membranes was developed and tested. Speedups of up to 50-times over CPU-based calculations were achieved, and simulations employing lattices of up to 1800 1800 sites were performed. The existence of large nonregular lipid domains of sizes up to 160 nm was demonstrated. This reveals the necessity to employ lattices of at least 900 900 sites to study the lateral lipid organization in complex lipid membranes.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GBP208%2F12%2FG016" target="_blank" >GBP208/12/G016: Řízení struktury a funkce biomolekul na molekulové úrovni: souhra teorie a experimentu</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Chemical Theory and Computation
ISSN
1549-9618
e-ISSN
—
Svazek periodika
8
Číslo periodika v rámci svazku
11
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
4758-4765
Kód UT WoS článku
000311191900074
EID výsledku v databázi Scopus
—