Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Functional Assay to Correlate Protein Oligomerization States with Membrane Pore Formation

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388955%3A_____%2F20%3A00534692" target="_blank" >RIV/61388955:_____/20:00534692 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://hdl.handle.net/11104/0312867" target="_blank" >http://hdl.handle.net/11104/0312867</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.0c03276" target="_blank" >10.1021/acs.analchem.0c03276</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Functional Assay to Correlate Protein Oligomerization States with Membrane Pore Formation

  • Popis výsledku v původním jazyce

    In-membrane oligomerization is decisive for the function (or dysfunction) of many proteins. Techniques were developed to characterize membrane-inserted oligomers and the hereby obtained oligomerization states were intuitively related to the function of these proteins. However, in many cases, it is unclear whether the obtained oligomerization states are functionally relevant or are merely the consequence of nonspecific aggregation. Using fibroblast growth factor 2 (FGF2) as a model system, we addressed this methodological challenge. FGF2 oligomerizes in a PI(4,5)P2-dependent manner at the inner plasma membrane leaflet. This process results in membrane insertion and the formation of a lipidic membrane pore, the key intermediate in unconventional secretion of FGF2. To tackle the problem of discriminating functional oligomers from irrelevant aggregates, we present a statistical single molecule and single vesicle assay determining the brightness of individually diffusing in-membrane oligomers and correlating their oligomerization state with membrane pore formation. Importantly, time-dependent membrane pore formation was analyzed with an ensemble of single vesicles providing detailed statistics. Our findings demonstrate that quantifying oligomeric states alone does not allow for a deep understanding of the structure–function relationship of membrane-inserted oligomers.

  • Název v anglickém jazyce

    Functional Assay to Correlate Protein Oligomerization States with Membrane Pore Formation

  • Popis výsledku anglicky

    In-membrane oligomerization is decisive for the function (or dysfunction) of many proteins. Techniques were developed to characterize membrane-inserted oligomers and the hereby obtained oligomerization states were intuitively related to the function of these proteins. However, in many cases, it is unclear whether the obtained oligomerization states are functionally relevant or are merely the consequence of nonspecific aggregation. Using fibroblast growth factor 2 (FGF2) as a model system, we addressed this methodological challenge. FGF2 oligomerizes in a PI(4,5)P2-dependent manner at the inner plasma membrane leaflet. This process results in membrane insertion and the formation of a lipidic membrane pore, the key intermediate in unconventional secretion of FGF2. To tackle the problem of discriminating functional oligomers from irrelevant aggregates, we present a statistical single molecule and single vesicle assay determining the brightness of individually diffusing in-membrane oligomers and correlating their oligomerization state with membrane pore formation. Importantly, time-dependent membrane pore formation was analyzed with an ensemble of single vesicles providing detailed statistics. Our findings demonstrate that quantifying oligomeric states alone does not allow for a deep understanding of the structure–function relationship of membrane-inserted oligomers.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10403 - Physical chemistry

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Analytical Chemistry

  • ISSN

    0003-2700

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    92

  • Číslo periodika v rámci svazku

    22

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    6

  • Strana od-do

    14861-14866

  • Kód UT WoS článku

    000592852900002

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85096123765