Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Computational investigation of natural compounds as potential main protease (M<sup>pro</sup>) inhibitors for SARS-CoV-2 virus

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388955%3A_____%2F22%3A00564990" target="_blank" >RIV/61388955:_____/22:00564990 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://hdl.handle.net/11104/0336561" target="_blank" >https://hdl.handle.net/11104/0336561</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiomed.2022.106318" target="_blank" >10.1016/j.compbiomed.2022.106318</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Computational investigation of natural compounds as potential main protease (M<sup>pro</sup>) inhibitors for SARS-CoV-2 virus

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is significantly impacting human lives, overburdening the healthcare system and weakening global economies. Plant-derived natural compounds are being largely tested for their efficacy against COVID-19 targets to combat SARS-CoV-2 infection. The SARS-CoV-2 Main protease (Mpro) is considered an appealing target because of its role in replication in host cells. We curated a set of 7809 natural compounds by combining the collections of five databases viz Dr Duke's Phytochemical and Ethnobotanical database, IMPPAT, PhytoHub, AromaDb and Zinc. We applied a rigorous computational approach to identify lead molecules from our curated compound set using docking, dynamic simulations, the free energy of binding and DFT calculations. Theaflavin and ginkgetin have emerged as better molecules with a similar inhibition profile in both SARS-CoV-2 and Omicron variants.

  • Název v anglickém jazyce

    Computational investigation of natural compounds as potential main protease (M<sup>pro</sup>) inhibitors for SARS-CoV-2 virus

  • Popis výsledku anglicky

    The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is significantly impacting human lives, overburdening the healthcare system and weakening global economies. Plant-derived natural compounds are being largely tested for their efficacy against COVID-19 targets to combat SARS-CoV-2 infection. The SARS-CoV-2 Main protease (Mpro) is considered an appealing target because of its role in replication in host cells. We curated a set of 7809 natural compounds by combining the collections of five databases viz Dr Duke's Phytochemical and Ethnobotanical database, IMPPAT, PhytoHub, AromaDb and Zinc. We applied a rigorous computational approach to identify lead molecules from our curated compound set using docking, dynamic simulations, the free energy of binding and DFT calculations. Theaflavin and ginkgetin have emerged as better molecules with a similar inhibition profile in both SARS-CoV-2 and Omicron variants.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10403 - Physical chemistry

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Computers in Biology Medicine

  • ISSN

    0010-4825

  • e-ISSN

    1879-0534

  • Svazek periodika

    151

  • Číslo periodika v rámci svazku

    DEC 2022

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    106318

  • Kód UT WoS článku

    000900239300004

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85142318385