Stabilizační energie vodíkově a disperzně vázaných párů bazí nukleových kyselin v krystalových geometriích a v NMR geometrii hairpinu 5'-d(GCGAAGC)-3': Výpočty v úplné bázové limitě metodami MP2 a CCSD(T)

Kód výsledku v IS VaVaI

RIV/61388963:_____/05:00020898 - isvavai.cz

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Stabilization energies of the hydrogen-bonded and stacked structures of nucleic acid base pairs in the crystal geometries of CG, AT, and AC DNA steps and in the NMR geometry of the 5'-d(GCGAAGC)-3' hairpin: Complete basis set calculations at the MP2 a...

Popis výsledku v původním jazyce

Stabilization energies of the H-bonded and stacked structures of a DNA base pair were studied in the crystal structures of adenine-thymine, cytosine-guanine, and adenine-cytosine steps as well as in the 5'-d(GCGAAGC)-3'hairpin (utilizing the NMR geometry). The stacking accounts for a significant part of the overall stabilization. It contributes equally to the stability of DNA as does H-bonding for AT rich DNAs while in the case of GC rich DNAs it forms about one third of the total stabilization.

Název v anglickém jazyce

Stabilization energies of the hydrogen-bonded and stacked structures of nucleic acid base pairs in the crystal geometries of CG, AT, and AC DNA steps and in the NMR geometry of the 5'-d(GCGAAGC)-3' hairpin: Complete basis set calculations at the MP2 a...

Popis výsledku anglicky

Stabilization energies of the H-bonded and stacked structures of a DNA base pair were studied in the crystal structures of adenine-thymine, cytosine-guanine, and adenine-cytosine steps as well as in the 5'-d(GCGAAGC)-3'hairpin (utilizing the NMR geometry). The stacking accounts for a significant part of the overall stabilization. It contributes equally to the stability of DNA as does H-bonding for AT rich DNAs while in the case of GC rich DNAs it forms about one third of the total stabilization.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

GA203/05/0009: Struktura a dynamika bází, párů bází nukleových kyselin, oligonukleotidů a jejich komplexů s vodou, ionty a léčivy

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Physical Chemistry. A

ISSN

1089-5639

e-ISSN

—

Svazek periodika

109

Číslo periodika v rámci svazku

-

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

1131-1136

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—