Korelace mezi termodynamickou stabilitou dvojšroubovice DNA a interakčními a solvatačními energiemi stavebních bloků DNA

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F08%3A00310559" target="_blank" >RIV/61388963:_____/08:00310559 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Correlation between the thermodynamic stability of DNA duplexes and the interaction and solvation energies of DNA building blocks

Popis výsledku v původním jazyce

The unwinding Gibbs energy (or duplex dissociation energy) is an important measure of the thermodynamic stability of DNA oligomers. This value can be measured experimentally or predicted by empirical models parametrised on experimental data. Our previously developed model based on accurate DFT-D calculations of interaction energies between nucleic acid bases corrected for solvation contribution. This work was successfully extended to cover variable lengths of oligomers. This model was further applied tooligomers containing inosine, an unnatural base. The results, however, are not satisfactory and it is clear that the model does not take into account all variables contributing to DNA stability.

Název v anglickém jazyce

Correlation between the thermodynamic stability of DNA duplexes and the interaction and solvation energies of DNA building blocks

Popis výsledku anglicky

The unwinding Gibbs energy (or duplex dissociation energy) is an important measure of the thermodynamic stability of DNA oligomers. This value can be measured experimentally or predicted by empirical models parametrised on experimental data. Our previously developed model based on accurate DFT-D calculations of interaction energies between nucleic acid bases corrected for solvation contribution. This work was successfully extended to cover variable lengths of oligomers. This model was further applied tooligomers containing inosine, an unnatural base. The results, however, are not satisfactory and it is clear that the model does not take into account all variables contributing to DNA stability.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2008

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Collection of Czechoslovak Chemical Communications

ISSN

0010-0765

e-ISSN

—

Svazek periodika

73

Číslo periodika v rámci svazku

2

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

14

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

000253884000003

EID výsledku v databázi Scopus

—