The DF-LCCSD(T0) correction of the .fi./.psi. force field dihedral parameters significantly influences the free energy profile of the alanine dipeptide

Kód výsledku v IS VaVaI

RIV/61388963:_____/11:00369287 - isvavai.cz

Výsledek na webu

http://dx.doi.org/10.1016/j.cplett.2011.01.030

DOI - Digital Object Identifier

10.1016/j.cplett.2011.01.030

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

The DF-LCCSD(T0) correction of the .fi./.psi. force field dihedral parameters significantly influences the free energy profile of the alanine dipeptide

Popis výsledku v původním jazyce

The conformational behavior of small peptides is mostly dictated by backbone rigidity, in which the phi/psi torsions seem to play the most important role. We show that ab initio-based corrections of the torsion parameters in the FF-FOM force field determined by the DF-LCCSD(T0) method significantly influence the quality and minimum localization on the 2D free energy surface of the alanine dipeptide (AD) along the phi and psi coordinates of the backbone torsion angles. The populations of the individual conformers are in good agreement with the experimental results published recently on the AD through an analysis of the amide III band and the Raman skeletal vibrations. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.

Název v anglickém jazyce

The DF-LCCSD(T0) correction of the .fi./.psi. force field dihedral parameters significantly influences the free energy profile of the alanine dipeptide

Popis výsledku anglicky

The conformational behavior of small peptides is mostly dictated by backbone rigidity, in which the phi/psi torsions seem to play the most important role. We show that ab initio-based corrections of the torsion parameters in the FF-FOM force field determined by the DF-LCCSD(T0) method significantly influence the quality and minimum localization on the 2D free energy surface of the alanine dipeptide (AD) along the phi and psi coordinates of the backbone torsion angles. The populations of the individual conformers are in good agreement with the experimental results published recently on the AD through an analysis of the amide III band and the Raman skeletal vibrations. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemical Physics Letters

ISSN

0009-2614

e-ISSN

—

Svazek periodika

503

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

NL - Nizozemsko

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

301-304

Kód UT WoS článku

000287187800024

EID výsledku v databázi Scopus

—