Sensitive Cell-Based Assay for Determination of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Coreceptor Tropism
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F13%3A00393023" target="_blank" >RIV/61388963:_____/13:00393023 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1128/JCM.00092-13" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1128/JCM.00092-13</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1128/JCM.00092-13" target="_blank" >10.1128/JCM.00092-13</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Sensitive Cell-Based Assay for Determination of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Coreceptor Tropism
Popis výsledku v původním jazyce
CCR5 antagonists are a powerful new class of antiretroviral drugs that require a companion assay to evaluate the presence of CXCR4-tropic viruses prior to use in human immunodeficiency virus (HIV)-infected individuals. In this study, we have developed, characterized, verified, and prevalidated a novel phenotypic test to determine HIV-1 coreceptor tropism (VERITROP) based on a sensitive cell-to-cell fusion assay. The env-expressing vectors were used in a cell-to-cell fusion assay to determine the presence of R5 and/or non-R5 HIV-1 variants within the viral population. Results were compared with (i) the original version of Trofile, (ii) population sequencing, and (iii) 454 pyrosequencing, with the genotypic data analyzed using several bioinformatics tools, i. e., the 11/24/25 rule, Geno2Pheno, and webPSSM. VERITROP consistently detected minority non-R5 variants from clinical specimens, with an analytical sensitivity of 0.3%, with viral loads of >= 1,000 copies/ml, and from B and non-B su
Název v anglickém jazyce
Sensitive Cell-Based Assay for Determination of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Coreceptor Tropism
Popis výsledku anglicky
CCR5 antagonists are a powerful new class of antiretroviral drugs that require a companion assay to evaluate the presence of CXCR4-tropic viruses prior to use in human immunodeficiency virus (HIV)-infected individuals. In this study, we have developed, characterized, verified, and prevalidated a novel phenotypic test to determine HIV-1 coreceptor tropism (VERITROP) based on a sensitive cell-to-cell fusion assay. The env-expressing vectors were used in a cell-to-cell fusion assay to determine the presence of R5 and/or non-R5 HIV-1 variants within the viral population. Results were compared with (i) the original version of Trofile, (ii) population sequencing, and (iii) 454 pyrosequencing, with the genotypic data analyzed using several bioinformatics tools, i. e., the 11/24/25 rule, Geno2Pheno, and webPSSM. VERITROP consistently detected minority non-R5 variants from clinical specimens, with an analytical sensitivity of 0.3%, with viral loads of >= 1,000 copies/ml, and from B and non-B su
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Clinical Microbiology
ISSN
0095-1137
e-ISSN
—
Svazek periodika
51
Číslo periodika v rámci svazku
5
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
1517-1527
Kód UT WoS článku
000317602100027
EID výsledku v databázi Scopus
—