Specific potassium ion interactions facilitate homocysteine binding to betaine-homocysteine S-methyltransferase
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F14%3A00435073" target="_blank" >RIV/61388963:_____/14:00435073 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1002/prot.24619" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1002/prot.24619</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1002/prot.24619" target="_blank" >10.1002/prot.24619</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Specific potassium ion interactions facilitate homocysteine binding to betaine-homocysteine S-methyltransferase
Popis výsledku v původním jazyce
Betaine-homocysteine S-methyltransferase (BHMT) is a zinc-dependent methyltransferase that uses betaine as the methyl donor for the remethylation of homocysteine to form methionine. This reaction supports S-adenosylmethionine biosynthesis, which is required for hundreds of methylation reactions in humans. Herein we report that BHMT is activated by potassium ions with an apparent K-M for K+ of about 100 mu M. The presence of potassium ions lowers the apparent K-M of the enzyme for homocysteine, but it does not affect the apparent K-M for betaine or the apparent k(cat) for either substrate. We employed molecular dynamics (MD) simulations to theoretically predict and protein crystallography to experimentally localize the binding site(s) for potassium ion(s). Simulations predicted that K+ ion would interact with residues Asp26 and/or Glu159. Our crystal structure of BHMT bound to homocysteine confirms these sites of interaction and reveals further contacts between K+ ion and BHMT residues
Název v anglickém jazyce
Specific potassium ion interactions facilitate homocysteine binding to betaine-homocysteine S-methyltransferase
Popis výsledku anglicky
Betaine-homocysteine S-methyltransferase (BHMT) is a zinc-dependent methyltransferase that uses betaine as the methyl donor for the remethylation of homocysteine to form methionine. This reaction supports S-adenosylmethionine biosynthesis, which is required for hundreds of methylation reactions in humans. Herein we report that BHMT is activated by potassium ions with an apparent K-M for K+ of about 100 mu M. The presence of potassium ions lowers the apparent K-M of the enzyme for homocysteine, but it does not affect the apparent K-M for betaine or the apparent k(cat) for either substrate. We employed molecular dynamics (MD) simulations to theoretically predict and protein crystallography to experimentally localize the binding site(s) for potassium ion(s). Simulations predicted that K+ ion would interact with residues Asp26 and/or Glu159. Our crystal structure of BHMT bound to homocysteine confirms these sites of interaction and reveals further contacts between K+ ion and BHMT residues
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Proteins-Structure, Function and Bioinformatics
ISSN
0887-3585
e-ISSN
—
Svazek periodika
82
Číslo periodika v rámci svazku
10
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
2552-2564
Kód UT WoS článku
000342849400022
EID výsledku v databázi Scopus
—