The SQM/COSMO filter: reliable native pose identification based on the quantum-mechanical description of protein-ligand interactions and implicit COSMO solvation

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F16%3A00458893" target="_blank" >RIV/61388963:_____/16:00458893 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/61989592:15310/16:33161482

Výsledek na webu

<a href="http://pubs.rsc.org/en/content/articlepdf/2016/cc/c5cc09499b" target="_blank" >http://pubs.rsc.org/en/content/articlepdf/2016/cc/c5cc09499b</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1039/c5cc09499b" target="_blank" >10.1039/c5cc09499b</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

The SQM/COSMO filter: reliable native pose identification based on the quantum-mechanical description of protein-ligand interactions and implicit COSMO solvation

Popis výsledku v původním jazyce

Current virtual screening tools are fast, but reliable scoring is elusive. Here, we present the 'SQM/COSMO filter', a novel scoring function featuring a quantitative semiempirical quantum mechanical (SQM) description of all types of noncovalent interactions coupled with implicit COSMO solvation. We show unequivocally that it outperforms eight widely used scoring functions. The accuracy and chemical generality of the SQM/COSMO filter make it a perfect tool for late stages of virtual screening.

Název v anglickém jazyce

The SQM/COSMO filter: reliable native pose identification based on the quantum-mechanical description of protein-ligand interactions and implicit COSMO solvation

Popis výsledku anglicky

Current virtual screening tools are fast, but reliable scoring is elusive. Here, we present the 'SQM/COSMO filter', a novel scoring function featuring a quantitative semiempirical quantum mechanical (SQM) description of all types of noncovalent interactions coupled with implicit COSMO solvation. We show unequivocally that it outperforms eight widely used scoring functions. The accuracy and chemical generality of the SQM/COSMO filter make it a perfect tool for late stages of virtual screening.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemical Communications

ISSN

1359-7345

e-ISSN

—

Svazek periodika

52

Číslo periodika v rámci svazku

16

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

3312-3315

Kód UT WoS článku

000370618400010

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-84958817901