Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Halogen Bonding in Nucleic Acid Complexes

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F17%3A00482693" target="_blank" >RIV/61388963:_____/17:00482693 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jmedchem.7b00329" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1021/acs.jmedchem.7b00329</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jmedchem.7b00329" target="_blank" >10.1021/acs.jmedchem.7b00329</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Halogen Bonding in Nucleic Acid Complexes

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Halogen bonding (X-bonding) has attracted notable attention among noncovalent interactions. This highly directional attraction between a halogen atom and an electron donor has been exploited in knowledge-based drug design. A great deal of information has been gathered about X-bonds in protein ligand complexes, as opposed to nucleic acid complexes. Here we provide a thorough analysis of nucleic acid complexes containing either halogenated building blocks or halogenated ligands. We analyzed close contacts between halogens and electron-rich moieties. The phosphate backbone oxygen is clearly the most common halogen acceptor. We identified 21 X-bonds within known structures of nucleic acid complexes. A vast majority of the X-bonds is formed by halogenated nucleobases, such as bromouridine, and feature excellent geometries. Noncovalent ligands have been found to form only interactions with suboptimal interaction geometries. Hence, the first X-bonded nucleic acid binder remains to be discovered.

  • Název v anglickém jazyce

    Halogen Bonding in Nucleic Acid Complexes

  • Popis výsledku anglicky

    Halogen bonding (X-bonding) has attracted notable attention among noncovalent interactions. This highly directional attraction between a halogen atom and an electron donor has been exploited in knowledge-based drug design. A great deal of information has been gathered about X-bonds in protein ligand complexes, as opposed to nucleic acid complexes. Here we provide a thorough analysis of nucleic acid complexes containing either halogenated building blocks or halogenated ligands. We analyzed close contacts between halogens and electron-rich moieties. The phosphate backbone oxygen is clearly the most common halogen acceptor. We identified 21 X-bonds within known structures of nucleic acid complexes. A vast majority of the X-bonds is formed by halogenated nucleobases, such as bromouridine, and feature excellent geometries. Noncovalent ligands have been found to form only interactions with suboptimal interaction geometries. Hence, the first X-bonded nucleic acid binder remains to be discovered.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10403 - Physical chemistry

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2017

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Medicinal Chemistry

  • ISSN

    0022-2623

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    60

  • Číslo periodika v rámci svazku

    21

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    8681-8690

  • Kód UT WoS článku

    000415140600001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85029713269