Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Dominant-negative SMARCA4 mutants alter the accessibility landscape of tissue-unrestricted enhancers

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F18%3A00489776" target="_blank" >RIV/61388963:_____/18:00489776 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41594-017-0007-3" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/s41594-017-0007-3</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41594-017-0007-3" target="_blank" >10.1038/s41594-017-0007-3</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Dominant-negative SMARCA4 mutants alter the accessibility landscape of tissue-unrestricted enhancers

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Mutation of SMARCA4 (BRG1), the ATPase of BAF (mSWI/SNF) and PBAF complexes, contributes to a range of malignancies and neurologic disorders. Unfortunately, the effects of SMARCA4 missense mutations have remained uncertain. Here we show that SMARCA4 cancer missense mutations target conserved ATPase surfaces and disrupt the mechanochemical cycle of remodeling. We find that heterozygous expression of mutants alters the open chromatin landscape at thousands of sites across the genome. Loss of DNA accessibility does not directly overlap with Polycomb accumulation, but is enriched in 'A compartments' at active enhancers, which lose H3K27ac but not H3K4me1. Affected positions include hundreds of sites identified as superenhancers in many tissues. Dominant-negative mutation induces pro-oncogenic expression changes, including increased expression of Myc and its target genes. Together, our data suggest that disruption of enhancer accessibility represents a key source of altered function in disorders with SMARCA4 mutations in a wide variety of tissues.

  • Název v anglickém jazyce

    Dominant-negative SMARCA4 mutants alter the accessibility landscape of tissue-unrestricted enhancers

  • Popis výsledku anglicky

    Mutation of SMARCA4 (BRG1), the ATPase of BAF (mSWI/SNF) and PBAF complexes, contributes to a range of malignancies and neurologic disorders. Unfortunately, the effects of SMARCA4 missense mutations have remained uncertain. Here we show that SMARCA4 cancer missense mutations target conserved ATPase surfaces and disrupt the mechanochemical cycle of remodeling. We find that heterozygous expression of mutants alters the open chromatin landscape at thousands of sites across the genome. Loss of DNA accessibility does not directly overlap with Polycomb accumulation, but is enriched in 'A compartments' at active enhancers, which lose H3K27ac but not H3K4me1. Affected positions include hundreds of sites identified as superenhancers in many tissues. Dominant-negative mutation induces pro-oncogenic expression changes, including increased expression of Myc and its target genes. Together, our data suggest that disruption of enhancer accessibility represents a key source of altered function in disorders with SMARCA4 mutations in a wide variety of tissues.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA16-06357S" target="_blank" >GA16-06357S: Strukturní podstata biologické funkce LEDGF/p75 a HRP-2</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nature structural & molecular biology

  • ISSN

    1545-9993

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    25

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    12

  • Strana od-do

    61-72

  • Kód UT WoS článku

    000423547700010

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85042743313