Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Tuning of Oxidation Potential of Ferrocene for Ratiometric Redox Labeling and Coding of Nucleotides and DNA

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F20%3A00520856" target="_blank" >RIV/61388963:_____/20:00520856 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68081707:_____/20:00520856 RIV/00216224:14740/20:00118367 RIV/00216208:11310/20:10420650

  • Výsledek na webu

    <a href="https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/chem.201904700" target="_blank" >https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/chem.201904700</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/chem.201904700" target="_blank" >10.1002/chem.201904700</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Tuning of Oxidation Potential of Ferrocene for Ratiometric Redox Labeling and Coding of Nucleotides and DNA

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Three sets of 7-deazaadenine and cytosine nucleosides and nucleoside triphosphates bearing either unsubstituted ferrocene, octamethylferrocene and ferrocenecarboxamide linked through an alkyne tether to position 7 or 5, respectively, were designed and synthesized. The modified dNFcXTPs were good substrates for KOD XL DNA polymerase in primer extension and were used for enzymatic synthesis of redox-labelled DNA probes. Square-wave voltammetry showed that the octamethylferrocene oxidation potential was shifted to lower values, whilst the ferrocenecarboxamide was shifted to higher potentials, as compared to ferrocene. Tailed PEX products containing different ratios of Fc-labelled A (dAFc) and FcPa-labelled C (dCFcPa) were synthesized and hybridized with capture oligonucleotides immobilized on gold electrodes to study the electrochemistry of the redoxlabelled DNA. Clearly distinguishable, fully orthogonal and ratiometric peaks were observed for the dAFc and dCFcPa bases in DNA, demonstrating their potential for use in redox coding of nucleobases and for the direct electrochemical measurement of the relative ratio of nucleobases in an unknown sequence of DNA.

  • Název v anglickém jazyce

    Tuning of Oxidation Potential of Ferrocene for Ratiometric Redox Labeling and Coding of Nucleotides and DNA

  • Popis výsledku anglicky

    Three sets of 7-deazaadenine and cytosine nucleosides and nucleoside triphosphates bearing either unsubstituted ferrocene, octamethylferrocene and ferrocenecarboxamide linked through an alkyne tether to position 7 or 5, respectively, were designed and synthesized. The modified dNFcXTPs were good substrates for KOD XL DNA polymerase in primer extension and were used for enzymatic synthesis of redox-labelled DNA probes. Square-wave voltammetry showed that the octamethylferrocene oxidation potential was shifted to lower values, whilst the ferrocenecarboxamide was shifted to higher potentials, as compared to ferrocene. Tailed PEX products containing different ratios of Fc-labelled A (dAFc) and FcPa-labelled C (dCFcPa) were synthesized and hybridized with capture oligonucleotides immobilized on gold electrodes to study the electrochemistry of the redoxlabelled DNA. Clearly distinguishable, fully orthogonal and ratiometric peaks were observed for the dAFc and dCFcPa bases in DNA, demonstrating their potential for use in redox coding of nucleobases and for the direct electrochemical measurement of the relative ratio of nucleobases in an unknown sequence of DNA.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10401 - Organic chemistry

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF16_019%2F0000729" target="_blank" >EF16_019/0000729: Chemická biologie pro vývoj nových terapií</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Chemistry - A European Journal

  • ISSN

    0947-6539

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    26

  • Číslo periodika v rámci svazku

    6

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    6

  • Strana od-do

    1286-1291

  • Kód UT WoS článku

    000506258100001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85077877583