Molecular Mechanism of LEDGF/p75 Dimerization
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F20%3A00533337" target="_blank" >RIV/61388963:_____/20:00533337 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388971:_____/20:00533337 RIV/68378050:_____/20:00539172 RIV/00216208:11310/20:10422204
Výsledek na webu
<a href="https://doi.org/10.1016/j.str.2020.08.012" target="_blank" >https://doi.org/10.1016/j.str.2020.08.012</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.str.2020.08.012" target="_blank" >10.1016/j.str.2020.08.012</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Molecular Mechanism of LEDGF/p75 Dimerization
Popis výsledku v původním jazyce
Dimerization of many eukaryotic transcription regulatory factors is critical for their function. Regulatory role of an epigenetic reader lens epithelium-derived growth factor/p75 (LEDGF/p75) requires at least two copies of this protein to overcome the nucleosome-induced barrier to transcription elongation. Moreover, various LEDGF/p75 binding partners are enriched for dimeric features, further underscoring the functional regulatory role of LEDGF/p75 dimerization. Here, we dissected the minimal dimerization region in the C-terminal part of LEDGF/p75 and, using paramagnetic NMR spectroscopy, identified the key molecular contacts that helped to refine the solution structure of the dimer. The LEDGF/p75 dimeric assembly is stabilized by domain swapping within the integrase binding domain and additional electrostatic „stapling“ of the negatively charged α helix formed in the intrinsically disordered C-terminal region. We validated the dimerization mechanism using structure-inspired dimerization defective LEDGF/p75 variants and chemical crosslinking coupled to mass spectrometry. We also show how dimerization might affect the LEDGF/p75 interactome.
Název v anglickém jazyce
Molecular Mechanism of LEDGF/p75 Dimerization
Popis výsledku anglicky
Dimerization of many eukaryotic transcription regulatory factors is critical for their function. Regulatory role of an epigenetic reader lens epithelium-derived growth factor/p75 (LEDGF/p75) requires at least two copies of this protein to overcome the nucleosome-induced barrier to transcription elongation. Moreover, various LEDGF/p75 binding partners are enriched for dimeric features, further underscoring the functional regulatory role of LEDGF/p75 dimerization. Here, we dissected the minimal dimerization region in the C-terminal part of LEDGF/p75 and, using paramagnetic NMR spectroscopy, identified the key molecular contacts that helped to refine the solution structure of the dimer. The LEDGF/p75 dimeric assembly is stabilized by domain swapping within the integrase binding domain and additional electrostatic „stapling“ of the negatively charged α helix formed in the intrinsically disordered C-terminal region. We validated the dimerization mechanism using structure-inspired dimerization defective LEDGF/p75 variants and chemical crosslinking coupled to mass spectrometry. We also show how dimerization might affect the LEDGF/p75 interactome.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Structure
ISSN
0969-2126
e-ISSN
—
Svazek periodika
28
Číslo periodika v rámci svazku
12
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
12
Strana od-do
1288-1299
Kód UT WoS článku
000595618300003
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85091914124