Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Anchored linear oligonucleotides: the effective tool for the real-time measurement of uracil DNA glycosylase activity

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F21%3A00547495" target="_blank" >RIV/61388963:_____/21:00547495 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61989592:15110/21:73607669 RIV/67985882:_____/21:00547495

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1098/rsob.210136" target="_blank" >https://doi.org/10.1098/rsob.210136</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1098/rsob.210136" target="_blank" >10.1098/rsob.210136</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Anchored linear oligonucleotides: the effective tool for the real-time measurement of uracil DNA glycosylase activity

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Base excision repair is one of the important DNA repair mechanisms in cells. The fundamental role in this complex process is played by DNA glycosylases. Here, we present a novel approach for the real-time measurement of uracil DNA glycosylase activity, which employs selected oligonucleotides immobilized on the surface of magnetic nanoparticles and Förster resonance energy transfer. We also show that the approach can be performed by surface plasmon resonance sensor technology. We demonstrate that the immobilization of oligonucleotides provides much more reliable data than the free oligonucleotides including molecular beacons. Moreover, our results show that the method provides the possibility to address the relationship between the efficiency of uracil DNA glycosylase activity and the arrangement of the used oligonucleotide probes. For instance, the introduction of the nick into oligonucleotide containing the target base (uracil) resulted in the substantial decrease of uracil DNA glycosylase activity of both the bacterial glycosylase and glycosylases naturally present in nuclear lysates.

  • Název v anglickém jazyce

    Anchored linear oligonucleotides: the effective tool for the real-time measurement of uracil DNA glycosylase activity

  • Popis výsledku anglicky

    Base excision repair is one of the important DNA repair mechanisms in cells. The fundamental role in this complex process is played by DNA glycosylases. Here, we present a novel approach for the real-time measurement of uracil DNA glycosylase activity, which employs selected oligonucleotides immobilized on the surface of magnetic nanoparticles and Förster resonance energy transfer. We also show that the approach can be performed by surface plasmon resonance sensor technology. We demonstrate that the immobilization of oligonucleotides provides much more reliable data than the free oligonucleotides including molecular beacons. Moreover, our results show that the method provides the possibility to address the relationship between the efficiency of uracil DNA glycosylase activity and the arrangement of the used oligonucleotide probes. For instance, the introduction of the nick into oligonucleotide containing the target base (uracil) resulted in the substantial decrease of uracil DNA glycosylase activity of both the bacterial glycosylase and glycosylases naturally present in nuclear lysates.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Open Biology

  • ISSN

    2046-2441

  • e-ISSN

    2046-2441

  • Svazek periodika

    11

  • Číslo periodika v rámci svazku

    10

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    16

  • Strana od-do

    210136

  • Kód UT WoS článku

    000708618300001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85119393090