Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

TRPM5 Channel Binds Calcium-Binding Proteins Calmodulin and S100A1

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F22%3A00556398" target="_blank" >RIV/61388963:_____/22:00556398 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11320/22:10441280 RIV/00216208:11130/22:10441280

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1021/acs.biochem.1c00647" target="_blank" >https://doi.org/10.1021/acs.biochem.1c00647</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.biochem.1c00647" target="_blank" >10.1021/acs.biochem.1c00647</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    TRPM5 Channel Binds Calcium-Binding Proteins Calmodulin and S100A1

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Melastatin transient receptor potential (TRPM) channels belong to one of the most significant subgroups of the transient receptor potential (TRP) channel family. Here, we studied the TRPM5 member, the receptor exposed to calcium-mediated activation, resulting in taste transduction. It is known that most TRP channels are highly modulated through interactions with extracellular and intracellular agents. The binding sites for these ligands are usually located at the intracellular N- and C-termini of the TRP channels, and they can demonstrate the character of an intrinsically disordered protein (IDP), which allows such a region to bind various types of molecules. We explored the N-termini of TRPM5 and found the intracellular regions for calcium-binding proteins (CBPs) the calmodulin (CaM) and calcium-binding protein S1 (S100A1) by in vitro binding assays. Furthermore, molecular docking and molecular dynamics simulations (MDs) of the discovered complexes confirmed their known common binding interface patterns and the uniqueness of the basic residues present in the TRPM binding regions for CaM/S100A1.

  • Název v anglickém jazyce

    TRPM5 Channel Binds Calcium-Binding Proteins Calmodulin and S100A1

  • Popis výsledku anglicky

    Melastatin transient receptor potential (TRPM) channels belong to one of the most significant subgroups of the transient receptor potential (TRP) channel family. Here, we studied the TRPM5 member, the receptor exposed to calcium-mediated activation, resulting in taste transduction. It is known that most TRP channels are highly modulated through interactions with extracellular and intracellular agents. The binding sites for these ligands are usually located at the intracellular N- and C-termini of the TRP channels, and they can demonstrate the character of an intrinsically disordered protein (IDP), which allows such a region to bind various types of molecules. We explored the N-termini of TRPM5 and found the intracellular regions for calcium-binding proteins (CBPs) the calmodulin (CaM) and calcium-binding protein S1 (S100A1) by in vitro binding assays. Furthermore, molecular docking and molecular dynamics simulations (MDs) of the discovered complexes confirmed their known common binding interface patterns and the uniqueness of the basic residues present in the TRPM binding regions for CaM/S100A1.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA19-04099S" target="_blank" >GA19-04099S: Role interakční sítě nukleofosminu v akutní myeloidní leukémii s mutovaným NPM</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Biochemistry

  • ISSN

    0006-2960

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    61

  • Číslo periodika v rámci svazku

    6

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    413-423

  • Kód UT WoS článku

    000771920200002

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85126069353