Traceless enzymatic synthesis of monodispersed hypermodified oligodeoxyribonucleotide polymers from RNA templates

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F22%3A00561972" target="_blank" >RIV/61388963:_____/22:00561972 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216208:11310/22:10451483

Výsledek na webu

<a href="https://doi.org/10.1039/D2CC03588J" target="_blank" >https://doi.org/10.1039/D2CC03588J</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1039/d2cc03588j" target="_blank" >10.1039/d2cc03588j</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Traceless enzymatic synthesis of monodispersed hypermodified oligodeoxyribonucleotide polymers from RNA templates

Popis výsledku v původním jazyce

We have developed a new alternative for enzymatic synthesis of single-stranded hypermodified oligodeoxyribonucleotides displaying four different hydrophobic groups based on reverse transcription from RNA templates catalyzed by DNA polymerases using a set of base-modified dNTPs followed by digestion of RNA by RNases. Using mixed oligodeoxyribonucleotide primers containing a ribonucleotide at the 3'-end, RNase AT1 simultaneously digested the template and cleaved off the primer to release a fully modified oligonucleotide that can be further 3'-labelled with a fluorescent nucleotide using TdT. The resulting hypermodified oligonucleotides could find applications in selection of aptamers or other functional macromolecules.

Název v anglickém jazyce

Traceless enzymatic synthesis of monodispersed hypermodified oligodeoxyribonucleotide polymers from RNA templates

Popis výsledku anglicky

We have developed a new alternative for enzymatic synthesis of single-stranded hypermodified oligodeoxyribonucleotides displaying four different hydrophobic groups based on reverse transcription from RNA templates catalyzed by DNA polymerases using a set of base-modified dNTPs followed by digestion of RNA by RNases. Using mixed oligodeoxyribonucleotide primers containing a ribonucleotide at the 3'-end, RNase AT1 simultaneously digested the template and cleaved off the primer to release a fully modified oligonucleotide that can be further 3'-labelled with a fluorescent nucleotide using TdT. The resulting hypermodified oligonucleotides could find applications in selection of aptamers or other functional macromolecules.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/GX20-00885X" target="_blank" >GX20-00885X: Nové funkcionalizované (bio)polymery na bázi dekorace DNA malými molekulami</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemical Communications

ISSN

1359-7345

e-ISSN

1364-548X

Svazek periodika

58

Číslo periodika v rámci svazku

80

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

11248-11251

Kód UT WoS článku

000855389100001

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85139378925