Distribution and Origin of Oxygen-Dependent and Oxygen-Independent Forms of Mg-Protoporphyrin Monomethylester Cyclase among Phototrophic Proteobacteria
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F13%3A00422207" target="_blank" >RIV/61388971:_____/13:00422207 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60076658:12310/13:43885373
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1128/AEM.00104-13" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1128/AEM.00104-13</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1128/AEM.00104-13" target="_blank" >10.1128/AEM.00104-13</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Distribution and Origin of Oxygen-Dependent and Oxygen-Independent Forms of Mg-Protoporphyrin Monomethylester Cyclase among Phototrophic Proteobacteria
Popis výsledku v původním jazyce
Magnesium-protoporphyrin IX monomethylester cyclase is one of the key enzymes of the bacteriochlorophyll biosynthesis pathway. There exist two fundamentally different forms of this enzyme. The oxygen-dependent form, encoded by the gene acsF, catalyzes the formation of the bacteriochlorophyll fifth ring using oxygen, whereas the oxygen-independent form encoded by the gene bchE utilizes an oxygen atom extracted from water. The presence of acsF and bchE genes was surveyed in various phototrophic Proteobacteria using the available genomic data and newly designed degenerated primers. It was found that while the majority of purple nonsulfur bacteria contained both forms of the cyclase, the purple sulfur bacteria contained only the oxygen-independent form. All tested species of aerobic anoxygenic phototrophs contained acsF genes, but some of them also retained the bchE gene. In contrast to bchE phylogeny, the acsF phylogeny was in good agreement with 16S inferred phylogeny. Moreover, the surv
Název v anglickém jazyce
Distribution and Origin of Oxygen-Dependent and Oxygen-Independent Forms of Mg-Protoporphyrin Monomethylester Cyclase among Phototrophic Proteobacteria
Popis výsledku anglicky
Magnesium-protoporphyrin IX monomethylester cyclase is one of the key enzymes of the bacteriochlorophyll biosynthesis pathway. There exist two fundamentally different forms of this enzyme. The oxygen-dependent form, encoded by the gene acsF, catalyzes the formation of the bacteriochlorophyll fifth ring using oxygen, whereas the oxygen-independent form encoded by the gene bchE utilizes an oxygen atom extracted from water. The presence of acsF and bchE genes was surveyed in various phototrophic Proteobacteria using the available genomic data and newly designed degenerated primers. It was found that while the majority of purple nonsulfur bacteria contained both forms of the cyclase, the purple sulfur bacteria contained only the oxygen-independent form. All tested species of aerobic anoxygenic phototrophs contained acsF genes, but some of them also retained the bchE gene. In contrast to bchE phylogeny, the acsF phylogeny was in good agreement with 16S inferred phylogeny. Moreover, the surv
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Applied and Environmental Microbiology
ISSN
0099-2240
e-ISSN
—
Svazek periodika
79
Číslo periodika v rámci svazku
8
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
2596-2604
Kód UT WoS článku
000316956200013
EID výsledku v databázi Scopus
—