The C-terminal domain of Brd2 is important for chromatin interaction and regulation of transcription and alternative splicing
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F13%3A00424234" target="_blank" >RIV/61388971:_____/13:00424234 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388955:_____/13:00422977 RIV/68378050:_____/13:00422977
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1091/mbc.E13-06-0303" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1091/mbc.E13-06-0303</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1091/mbc.E13-06-0303" target="_blank" >10.1091/mbc.E13-06-0303</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
The C-terminal domain of Brd2 is important for chromatin interaction and regulation of transcription and alternative splicing
Popis výsledku v původním jazyce
Brd2 is a member of the bromodomain extra terminal (BET) protein family, which consists of four chromatin-interacting proteins that regulate gene expression. Each BET protein contains two N-terminal bromodomains, which recognize acetylated histones, andthe C-terminal protein-protein interaction domain. Using a genome-wide screen, we identify 1450 genes whose transcription is regulated by Brd2. In addition, almost 290 genes change their alternative splicing pattern upon Brd2 depletion. Brd2 is specifically localized at promoters of target genes, and our data show that Brd2 interaction with chromatin cannot be explained solely by histone acetylation. Using coimmunoprecipitation and live-cell imaging, we show that the C-terminal part is crucial for Brd2association with chromatin. Live-cell microscopy also allows us to map the average binding time of Brd2 to chromatin and quantify the contributions of individual Brd2 domains to the interaction with chromatin. Finally, we show that bromod
Název v anglickém jazyce
The C-terminal domain of Brd2 is important for chromatin interaction and regulation of transcription and alternative splicing
Popis výsledku anglicky
Brd2 is a member of the bromodomain extra terminal (BET) protein family, which consists of four chromatin-interacting proteins that regulate gene expression. Each BET protein contains two N-terminal bromodomains, which recognize acetylated histones, andthe C-terminal protein-protein interaction domain. Using a genome-wide screen, we identify 1450 genes whose transcription is regulated by Brd2. In addition, almost 290 genes change their alternative splicing pattern upon Brd2 depletion. Brd2 is specifically localized at promoters of target genes, and our data show that Brd2 interaction with chromatin cannot be explained solely by histone acetylation. Using coimmunoprecipitation and live-cell imaging, we show that the C-terminal part is crucial for Brd2association with chromatin. Live-cell microscopy also allows us to map the average binding time of Brd2 to chromatin and quantify the contributions of individual Brd2 domains to the interaction with chromatin. Finally, we show that bromod
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Molecular Biology of the Cell
ISSN
1059-1524
e-ISSN
—
Svazek periodika
24
Číslo periodika v rámci svazku
22
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
12
Strana od-do
3557-3568
Kód UT WoS článku
000328124600007
EID výsledku v databázi Scopus
—