Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Duplex formation between the sRNA DsrA and rpoS mRNA is not sufficient for efficient RpoS synthesis at low temperature

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F13%3A00426561" target="_blank" >RIV/61388971:_____/13:00426561 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24448230" target="_blank" >http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24448230</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.4161/rna.27100" target="_blank" >10.4161/rna.27100</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Duplex formation between the sRNA DsrA and rpoS mRNA is not sufficient for efficient RpoS synthesis at low temperature

  • Popis výsledku v původním jazyce

    At low temperatures the Escherichia coli rpoS mRNA, encoding the stationary phase sigma factor RpoS, forms an intramolecular secondary structure (iss) that impedes translation initiation. Under these conditions the small RNA DsrA, which is stabilzed by Hfq, forms a duplex with rpoS mRNA sequences opposite of the ribosome-binding site (rbs). Both the DEAD box helicase CsdA and Hfq have been implicated in DsrArpoS duplex formation. Hfq binding to A-rich sequences in the rpoS leader has been suggested to restructure the mRNA, and thereby to accelerate DsrArpoS duplex formation, which, in turn, was deemed to free the rpoS rbs and to permit ribosome loading on the mRNA. Several experiments designed to elucidate the role of Hfq in DsrA-mediated translationalactivation of rpoS mRNA have been conducted in vitro. Here, we assessed RpoS synthesis in vivo to further study the role of Hfq in rpoS regulation. We show that RpoS synthesis was reduced when DsrA was ectopically overexpressed at 24 °C

  • Název v anglickém jazyce

    Duplex formation between the sRNA DsrA and rpoS mRNA is not sufficient for efficient RpoS synthesis at low temperature

  • Popis výsledku anglicky

    At low temperatures the Escherichia coli rpoS mRNA, encoding the stationary phase sigma factor RpoS, forms an intramolecular secondary structure (iss) that impedes translation initiation. Under these conditions the small RNA DsrA, which is stabilzed by Hfq, forms a duplex with rpoS mRNA sequences opposite of the ribosome-binding site (rbs). Both the DEAD box helicase CsdA and Hfq have been implicated in DsrArpoS duplex formation. Hfq binding to A-rich sequences in the rpoS leader has been suggested to restructure the mRNA, and thereby to accelerate DsrArpoS duplex formation, which, in turn, was deemed to free the rpoS rbs and to permit ribosome loading on the mRNA. Several experiments designed to elucidate the role of Hfq in DsrA-mediated translationalactivation of rpoS mRNA have been conducted in vitro. Here, we assessed RpoS synthesis in vivo to further study the role of Hfq in rpoS regulation. We show that RpoS synthesis was reduced when DsrA was ectopically overexpressed at 24 °C

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EE - Mikrobiologie, virologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2013

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    RNA biology

  • ISSN

    1547-6286

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    10

  • Číslo periodika v rámci svazku

    12

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    8

  • Strana od-do

    1834-1841

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus