The stress-related, rhizobial small RNA RcsR1 destabilizes the autoinducer synthase encoding mRNA sinI in Sinorhizobium meliloti

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F16%3A00462939" target="_blank" >RIV/61388971:_____/16:00462939 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216208:11110/16:10327980

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1080/15476286.2015.1110673" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1080/15476286.2015.1110673</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1080/15476286.2015.1110673" target="_blank" >10.1080/15476286.2015.1110673</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

The stress-related, rhizobial small RNA RcsR1 destabilizes the autoinducer synthase encoding mRNA sinI in Sinorhizobium meliloti

Popis výsledku v původním jazyce

Quorum sensing is a cell density-dependent communication system of bacteria relying on autoinducer molecules. During the analysis of the post-transcriptional regulation of quorum sensing in the nitrogen fixing plant symbiont Sinorhizobium meliloti, we predicted and verified a direct interaction between the 5'-UTR of sinI mRNA encoding the autoinducer synthase and a small RNA (sRNA), which we named RcsR1. In vitro, RcsR1 prevented cleavage in the 5'-UTR of sinI by RNase E and impaired sinI translation. In line with low ribosomal occupancy and transcript destabilization upon binding of RcsR1 to sinI, overproduction of RcsR1 in S. meliloti resulted in lower level and shorter half-life of sinI mRNA, and in decreased autoinducer amount

Název v anglickém jazyce

The stress-related, rhizobial small RNA RcsR1 destabilizes the autoinducer synthase encoding mRNA sinI in Sinorhizobium meliloti

Popis výsledku anglicky

Quorum sensing is a cell density-dependent communication system of bacteria relying on autoinducer molecules. During the analysis of the post-transcriptional regulation of quorum sensing in the nitrogen fixing plant symbiont Sinorhizobium meliloti, we predicted and verified a direct interaction between the 5'-UTR of sinI mRNA encoding the autoinducer synthase and a small RNA (sRNA), which we named RcsR1. In vitro, RcsR1 prevented cleavage in the 5'-UTR of sinI by RNase E and impaired sinI translation. In line with low ribosomal occupancy and transcript destabilization upon binding of RcsR1 to sinI, overproduction of RcsR1 in S. meliloti resulted in lower level and shorter half-life of sinI mRNA, and in decreased autoinducer amount

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

RNA biology

ISSN

1547-6286

e-ISSN

—

Svazek periodika

13

Číslo periodika v rámci svazku

5

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

14

Strana od-do

486-499

Kód UT WoS článku

000382957600003

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-84963613846