Influence of ligand binding on structure and thermostability of human alpha(1)-acid glycoprotein
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F16%3A00463165" target="_blank" >RIV/61388971:_____/16:00463165 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60076658:12310/16:43890978
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1002/jmr.2496" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1002/jmr.2496</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1002/jmr.2496" target="_blank" >10.1002/jmr.2496</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Influence of ligand binding on structure and thermostability of human alpha(1)-acid glycoprotein
Popis výsledku v původním jazyce
Ligand binding of neutral progesterone, basic propranolol, and acidic warfarin to human alpha(1)-acid glycoprotein (AGP) was investigated by Raman spectroscopy. The binding itself is characterized by a uniform conformational shift in which a tryptophan residue is involved. Slight differences corresponding to different contacts of the individual ligands inside the beta-barrel are described. Results are compared with in silico ligand docking into the available crystal structure of deglycosylated AGP using quantum/molecular mechanics. Calculated binding energies are -18.2, -14.5, and -11.5 kcal/mol for warfarin, propranolol, and progesterone, respectively. These calculations are consistent with Raman difference spectroscopy; nevertheless, minor discrepancies in the precise positions of the ligands point to structural differences between deglycosylated and native AGP.
Název v anglickém jazyce
Influence of ligand binding on structure and thermostability of human alpha(1)-acid glycoprotein
Popis výsledku anglicky
Ligand binding of neutral progesterone, basic propranolol, and acidic warfarin to human alpha(1)-acid glycoprotein (AGP) was investigated by Raman spectroscopy. The binding itself is characterized by a uniform conformational shift in which a tryptophan residue is involved. Slight differences corresponding to different contacts of the individual ligands inside the beta-barrel are described. Results are compared with in silico ligand docking into the available crystal structure of deglycosylated AGP using quantum/molecular mechanics. Calculated binding energies are -18.2, -14.5, and -11.5 kcal/mol for warfarin, propranolol, and progesterone, respectively. These calculations are consistent with Raman difference spectroscopy; nevertheless, minor discrepancies in the precise positions of the ligands point to structural differences between deglycosylated and native AGP.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Molecular Recognition
ISSN
0952-3499
e-ISSN
—
Svazek periodika
29
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
70-79
Kód UT WoS článku
000368640400002
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-84955666818