Fungal Communities in Soils: Soil Organic Matter Degradation
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F16%3A00472656" target="_blank" >RIV/61388971:_____/16:00472656 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-3369-3_5" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-3369-3_5</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-3369-3_5" target="_blank" >10.1007/978-1-4939-3369-3_5</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Fungal Communities in Soils: Soil Organic Matter Degradation
Popis výsledku v původním jazyce
Stable isotope probing (SIP) provides the opportunity to label decomposer microorganisms that build their biomass on a specific substrate. In combination with high-throughput sequencing, SIP allows for the identification of fungal community members involved in a particular decomposition process. Further information can be gained through gene-targeted metagenomics and metatranscriptomics, opening the possibility to describe the pool of genes catalyzing specific decomposition reactions in situ and to identify the diversity of genes that are expressed. When combined with gene descriptions of fungal isolates from the same environment, specific biochemical reactions involved in decomposition can be linked to individual fungal taxa. Here we describe the use of these methods to explore the cellulolytic fungal community in forest litter and soil.
Název v anglickém jazyce
Fungal Communities in Soils: Soil Organic Matter Degradation
Popis výsledku anglicky
Stable isotope probing (SIP) provides the opportunity to label decomposer microorganisms that build their biomass on a specific substrate. In combination with high-throughput sequencing, SIP allows for the identification of fungal community members involved in a particular decomposition process. Further information can be gained through gene-targeted metagenomics and metatranscriptomics, opening the possibility to describe the pool of genes catalyzing specific decomposition reactions in situ and to identify the diversity of genes that are expressed. When combined with gene descriptions of fungal isolates from the same environment, specific biochemical reactions involved in decomposition can be linked to individual fungal taxa. Here we describe the use of these methods to explore the cellulolytic fungal community in forest litter and soil.
Klasifikace
Druh
C - Kapitola v odborné knize
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA13-06763S" target="_blank" >GA13-06763S: Houby v lesních půdách a opadu: biogeografie a ekologie v regionálním měřítku</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název knihy nebo sborníku
Microbial Environmental Genomics (MEG)
ISBN
978-1-4939-3369-3
Počet stran výsledku
12
Strana od-do
89-100-89-100
Počet stran knihy
321
Název nakladatele
HUMANA PRESS INC
Místo vydání
Totowa
Kód UT WoS kapitoly
—