Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Overproduction and characterization of the first enzyme of a new aldoxime dehydratase family in Bradyrhizobium sp

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F18%3A00491995" target="_blank" >RIV/61388971:_____/18:00491995 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11310/18:10378082

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2018.04.103" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2018.04.103</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2018.04.103" target="_blank" >10.1016/j.ijbiomac.2018.04.103</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Overproduction and characterization of the first enzyme of a new aldoxime dehydratase family in Bradyrhizobium sp

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Almost 100 genes within the genus Bradyrhizobium are known to potentially encode aldoxime dehydratases (Oxds), but none of the corresponding proteins have been characterized yet. Aldoximes are natural substances involved in plant defense and auxin synthesis, and Oxds are components of enzymatic cascades enabling bacteria to transform, utilize and detoxify them. The aim of this work was to characterize a representative of the highly conserved Oxds in Bradyrhizobium spp. which include both plant symbionts and members of the soil communities. The selected oxd gene from Bradyrhizobium sp. LTSPM299 was expressed in Escherichia coli, and the corresponding gene product (OxdBr1, GenBank: WP_044589203) was obtained as an N-His(6)-tagged protein (monomer, 40.7 kDa) with 30-47% identity to Oxds characterized previously. OxdBrl was most stable at pH ca. 7.0-8.0 and at up to 30 degrees C. As substrates, the enzyme acted on (aryl)aliphatic aldoximes such as E/Z-phenylacetaldoxime, E/Z-2-phenylpropionaldoxime, E/Z-3-phenylpropionaldoxime, E/Z-indole-3-acetaldoxime, E/Z-propionaldoxime, E/Z-butyraldoxime, E/Z-valeraldoxime and E/Z-isovaleraldoxime. Some of the reaction products of OxdBrl are substrates of nitrilases occurring in the same genus. Regions upstream of the oxd gene contained genes encoding a putative aliphatic nitrilase and its transcriptional activator, indicating the participation of OxdBrl in the metabolic route from aldoximes to carboxylic acids.

  • Název v anglickém jazyce

    Overproduction and characterization of the first enzyme of a new aldoxime dehydratase family in Bradyrhizobium sp

  • Popis výsledku anglicky

    Almost 100 genes within the genus Bradyrhizobium are known to potentially encode aldoxime dehydratases (Oxds), but none of the corresponding proteins have been characterized yet. Aldoximes are natural substances involved in plant defense and auxin synthesis, and Oxds are components of enzymatic cascades enabling bacteria to transform, utilize and detoxify them. The aim of this work was to characterize a representative of the highly conserved Oxds in Bradyrhizobium spp. which include both plant symbionts and members of the soil communities. The selected oxd gene from Bradyrhizobium sp. LTSPM299 was expressed in Escherichia coli, and the corresponding gene product (OxdBr1, GenBank: WP_044589203) was obtained as an N-His(6)-tagged protein (monomer, 40.7 kDa) with 30-47% identity to Oxds characterized previously. OxdBrl was most stable at pH ca. 7.0-8.0 and at up to 30 degrees C. As substrates, the enzyme acted on (aryl)aliphatic aldoximes such as E/Z-phenylacetaldoxime, E/Z-2-phenylpropionaldoxime, E/Z-3-phenylpropionaldoxime, E/Z-indole-3-acetaldoxime, E/Z-propionaldoxime, E/Z-butyraldoxime, E/Z-valeraldoxime and E/Z-isovaleraldoxime. Some of the reaction products of OxdBrl are substrates of nitrilases occurring in the same genus. Regions upstream of the oxd gene contained genes encoding a putative aliphatic nitrilase and its transcriptional activator, indicating the participation of OxdBrl in the metabolic route from aldoximes to carboxylic acids.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LD15107" target="_blank" >LD15107: Nové aldoximdehydratasy: izolace, charakterizace a využití pro biokatalytické moduly</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Biological Macromolecules

  • ISSN

    0141-8130

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    115

  • Číslo periodika v rámci svazku

    AUG 2018

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    8

  • Strana od-do

    746-753

  • Kód UT WoS článku

    000438662500083

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85046136167