cpPredictor: a web server for template-based prediction of RNA secondary structure

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F19%3A00500029" target="_blank" >RIV/61388971:_____/19:00500029 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/35/7/1231/5086391?redirectedFrom=fulltext" target="_blank" >https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/35/7/1231/5086391?redirectedFrom=fulltext</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bty753" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/bty753</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

cpPredictor: a web server for template-based prediction of RNA secondary structure

Popis výsledku v původním jazyce

We present the cpPredictor webserver that implements a novel template-based method for prediction of secondary structure of RNA. The method outperforms available prediction methods as it uses RNA structures of related molecules, either predicted or experimentally identified, as structural templates. The server aims at three major tasks: i) prediction of RNA secondary structuresnthat are difficult to predict by available methods, ii) characterization of uncharacterized RNAs as compatible or incompatible with a chosen template structure and iii) an identification of the most relevant structure among different candidate structures of a single RNA ambiguously predicted by available methods. The web server is accompanied with a comprehensive documentation.nn

Název v anglickém jazyce

cpPredictor: a web server for template-based prediction of RNA secondary structure

Popis výsledku anglicky

We present the cpPredictor webserver that implements a novel template-based method for prediction of secondary structure of RNA. The method outperforms available prediction methods as it uses RNA structures of related molecules, either predicted or experimentally identified, as structural templates. The server aims at three major tasks: i) prediction of RNA secondary structuresnthat are difficult to predict by available methods, ii) characterization of uncharacterized RNAs as compatible or incompatible with a chosen template structure and iii) an identification of the most relevant structure among different candidate structures of a single RNA ambiguously predicted by available methods. The web server is accompanied with a comprehensive documentation.nn

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Bioinformatics

ISSN

1367-4803

e-ISSN

—

Svazek periodika

35

Číslo periodika v rámci svazku

7

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

1231-1233

Kód UT WoS článku

000465085400020

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85064130483