Switching transcription with bacterial RNA polymerase through photocaging, photorelease and phosphorylation reactions in the major groove of DNA
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F19%3A00505476" target="_blank" >RIV/61388971:_____/19:00505476 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388963:_____/19:00505476 RIV/00216208:11310/19:10394788
Výsledek na webu
<a href="https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2019/SC/C9SC00205G#!divAbstract" target="_blank" >https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2019/SC/C9SC00205G#!divAbstract</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1039/c9sc00205g" target="_blank" >10.1039/c9sc00205g</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Switching transcription with bacterial RNA polymerase through photocaging, photorelease and phosphorylation reactions in the major groove of DNA
Popis výsledku v původním jazyce
We report proof of principle biomimetic switching of transcription in vitro through non-natural chemical reactions in the major groove of DNA templates. Photocaged DNA templates containing nitrobenzyl-protected 5-hydroxymethyluracil or -cytosine permitted no transcription with E. coli RNA polymerase (OFF state). Their irradiation with 400 nm light resulted in DNA templates containing hydroxymethylpyrimidines, which switched transcription ON with a higher yield (250-350%) compared to non-modified DNA. Phosphorylation of templates containing 5-hydroxymethyluracil (but not 5-hydroxymethylcytosine) then turned transcription OFF again. It is the first step towards artificial bioorthogonal chemical epigenetics.
Název v anglickém jazyce
Switching transcription with bacterial RNA polymerase through photocaging, photorelease and phosphorylation reactions in the major groove of DNA
Popis výsledku anglicky
We report proof of principle biomimetic switching of transcription in vitro through non-natural chemical reactions in the major groove of DNA templates. Photocaged DNA templates containing nitrobenzyl-protected 5-hydroxymethyluracil or -cytosine permitted no transcription with E. coli RNA polymerase (OFF state). Their irradiation with 400 nm light resulted in DNA templates containing hydroxymethylpyrimidines, which switched transcription ON with a higher yield (250-350%) compared to non-modified DNA. Phosphorylation of templates containing 5-hydroxymethyluracil (but not 5-hydroxymethylcytosine) then turned transcription OFF again. It is the first step towards artificial bioorthogonal chemical epigenetics.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10606 - Microbiology
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Chemical Science
ISSN
2041-6520
e-ISSN
—
Svazek periodika
10
Číslo periodika v rámci svazku
14
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
6
Strana od-do
3937-3942
Kód UT WoS článku
000467988600024
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85064060087