Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Allelic Variants for Candidate Nitrogen Fixation Genes Revealed by Sequencing in Red Clover (Trifolium pratense L.)

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F19%3A00519365" target="_blank" >RIV/61388971:_____/19:00519365 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60076658:12310/19:43899775 RIV/00216224:14310/19:00108397 RIV/26296080:_____/19:N0000131

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.mdpi.com/1422-0067/20/21/5470" target="_blank" >https://www.mdpi.com/1422-0067/20/21/5470</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/ijms20215470" target="_blank" >10.3390/ijms20215470</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Allelic Variants for Candidate Nitrogen Fixation Genes Revealed by Sequencing in Red Clover (Trifolium pratense L.)

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Plant-rhizobia symbiosis can activate key genes involved in regulating nodulation associated with biological nitrogen fixation (BNF). Although the general molecular basis of the BNF process is frequently studied, little is known about its intraspecific variability and the characteristics of its allelic variants. This study's main goals were to describe phenotypic and genotypic variation in the context of nitrogen fixation in red clover (Trifolium pretense L.) and identify variants in BNF candidate genes associated with BNF efficiency. Acetylene reduction assay validation was the criterion for selecting individual plants with particular BNF rates. Sequences in 86 key candidate genes were obtained by hybridization-based sequence capture target enrichment of plants with alternative phenotypes for nitrogen fixation. Two genes associated with BNF were identified: ethylene response factor required for nodule differentiation (EFD) and molybdate transporter 1 (MOT1). In addition, whole-genome population genotyping by double-digest restriction-site-associated sequencing (ddRADseq) was performed, and BNF was evaluated by the natural N-15 abundance method. Polymorphisms associated with BNF and reflecting phenotype variability were identified. The genetic structure of plant accessions was not linked to BNF rate of measured plants. Knowledge of the genetic variation within BNF candidate genes and the characteristics of genetic variants will be beneficial in molecular diagnostics and breeding of red clover.

  • Název v anglickém jazyce

    Allelic Variants for Candidate Nitrogen Fixation Genes Revealed by Sequencing in Red Clover (Trifolium pratense L.)

  • Popis výsledku anglicky

    Plant-rhizobia symbiosis can activate key genes involved in regulating nodulation associated with biological nitrogen fixation (BNF). Although the general molecular basis of the BNF process is frequently studied, little is known about its intraspecific variability and the characteristics of its allelic variants. This study's main goals were to describe phenotypic and genotypic variation in the context of nitrogen fixation in red clover (Trifolium pretense L.) and identify variants in BNF candidate genes associated with BNF efficiency. Acetylene reduction assay validation was the criterion for selecting individual plants with particular BNF rates. Sequences in 86 key candidate genes were obtained by hybridization-based sequence capture target enrichment of plants with alternative phenotypes for nitrogen fixation. Two genes associated with BNF were identified: ethylene response factor required for nodule differentiation (EFD) and molybdate transporter 1 (MOT1). In addition, whole-genome population genotyping by double-digest restriction-site-associated sequencing (ddRADseq) was performed, and BNF was evaluated by the natural N-15 abundance method. Polymorphisms associated with BNF and reflecting phenotype variability were identified. The genetic structure of plant accessions was not linked to BNF rate of measured plants. Knowledge of the genetic variation within BNF candidate genes and the characteristics of genetic variants will be beneficial in molecular diagnostics and breeding of red clover.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/TH02010351" target="_blank" >TH02010351: Efektivní biotechnologie pro syntézu populačních čipů a její ověření na pilotní matrici rostlinného materiálu</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Molecular Sciences

  • ISSN

    1422-0067

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    20

  • Číslo periodika v rámci svazku

    21

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    26

  • Strana od-do

    5470

  • Kód UT WoS článku

    000498946100228

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85074540022