Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Genetic and Functional Diversity of Nitrilases in Agaricomycotina

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F19%3A00519687" target="_blank" >RIV/61388971:_____/19:00519687 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.mdpi.com/1422-0067/20/23/5990" target="_blank" >https://www.mdpi.com/1422-0067/20/23/5990</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/ijms20235990" target="_blank" >10.3390/ijms20235990</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Genetic and Functional Diversity of Nitrilases in Agaricomycotina

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Nitrilases participate in the nitrile metabolism in microbes and plants. They are widely used to produce carboxylic acids from nitriles. Nitrilases were described in bacteria, Ascomycota and plants. However, they remain unexplored in Basidiomycota. Yet more than 200 putative nitrilases are found in this division via GenBank. The majority of them occur in the subdivision Agaricomycotina. In this work, we analyzed their sequences and classified them into phylogenetic clades. Members of clade 1 (61 proteins) and 2 (25 proteins) are similar to plant nitrilases and nitrilases from Ascomycota, respectively, with sequence identities of around 50%. The searches also identified five putative cyanide hydratases (CynHs). Representatives of clade 1 and 2 (NitTv1 from Trametes versicolor and NitAg from Armillaria gallica, respectively) and a putative CynH (NitSh from Stereum hirsutum) were overproduced in Escherichia coli. The substrates of NitTv1 were fumaronitrile, 3-phenylpropionitrile, beta-cyano-l-alanine and 4-cyanopyridine, and those of NitSh were hydrogen cyanide (HCN), 2-cyanopyridine, fumaronitrile and benzonitrile. NitAg only exhibited activities for HCN and fumaronitrile. The substrate specificities of these nitrilases were largely in accordance with substrate docking in their homology models. The phylogenetic distribution of each type of nitrilase was determined for the first time.

  • Název v anglickém jazyce

    Genetic and Functional Diversity of Nitrilases in Agaricomycotina

  • Popis výsledku anglicky

    Nitrilases participate in the nitrile metabolism in microbes and plants. They are widely used to produce carboxylic acids from nitriles. Nitrilases were described in bacteria, Ascomycota and plants. However, they remain unexplored in Basidiomycota. Yet more than 200 putative nitrilases are found in this division via GenBank. The majority of them occur in the subdivision Agaricomycotina. In this work, we analyzed their sequences and classified them into phylogenetic clades. Members of clade 1 (61 proteins) and 2 (25 proteins) are similar to plant nitrilases and nitrilases from Ascomycota, respectively, with sequence identities of around 50%. The searches also identified five putative cyanide hydratases (CynHs). Representatives of clade 1 and 2 (NitTv1 from Trametes versicolor and NitAg from Armillaria gallica, respectively) and a putative CynH (NitSh from Stereum hirsutum) were overproduced in Escherichia coli. The substrates of NitTv1 were fumaronitrile, 3-phenylpropionitrile, beta-cyano-l-alanine and 4-cyanopyridine, and those of NitSh were hydrogen cyanide (HCN), 2-cyanopyridine, fumaronitrile and benzonitrile. NitAg only exhibited activities for HCN and fumaronitrile. The substrate specificities of these nitrilases were largely in accordance with substrate docking in their homology models. The phylogenetic distribution of each type of nitrilase was determined for the first time.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10612 - Mycology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA18-00184S" target="_blank" >GA18-00184S: Nové proteiny "nitrilasové nadrodiny" u Basidiomycot: studium jejich aktivit a možných funkcí v biodegradaci kyanidu a nitrilů</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Molecular Sciences

  • ISSN

    1422-0067

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    20

  • Číslo periodika v rámci svazku

    23

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    19

  • Strana od-do

    5990

  • Kód UT WoS článku

    000504428300172

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85075716861