CycloBranch 2: Molecular Formula Annotations Applied to imzML Data Sets in Bimodal Fusion and LC-MS Data Files

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F20%3A00524394" target="_blank" >RIV/61388971:_____/20:00524394 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.0c00170" target="_blank" >https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.0c00170</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.0c00170" target="_blank" >10.1021/acs.analchem.0c00170</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

CycloBranch 2: Molecular Formula Annotations Applied to imzML Data Sets in Bimodal Fusion and LC-MS Data Files

Popis výsledku v původním jazyce

Natural product chemistry, microbiology, and food, human, and plant metabolomics represent a few sources of complex metabolomics data generated by mass spectrometry. Among the medley of software tools used to handle these data sets, no universal tool can qualitatively, quantitatively, or statistically address major biological questions or tasks. CycloBranch 2, an open and platform-free software, at least now provides the de novo generation of molecular formulas of unknown compounds in both liquid chromatography/mass spectrometry and mass spectrometry imaging datafiles. For imaging files, this database-free approach was documented in the bimodal image fusion and characterization of three small molecules, including metallophores. The fine isotope ratio data filtering step distinguished 34S/13C2 and 41K/13C2 features.

Název v anglickém jazyce

CycloBranch 2: Molecular Formula Annotations Applied to imzML Data Sets in Bimodal Fusion and LC-MS Data Files

Popis výsledku anglicky

Natural product chemistry, microbiology, and food, human, and plant metabolomics represent a few sources of complex metabolomics data generated by mass spectrometry. Among the medley of software tools used to handle these data sets, no universal tool can qualitatively, quantitatively, or statistically address major biological questions or tasks. CycloBranch 2, an open and platform-free software, at least now provides the de novo generation of molecular formulas of unknown compounds in both liquid chromatography/mass spectrometry and mass spectrometry imaging datafiles. For imaging files, this database-free approach was documented in the bimodal image fusion and characterization of three small molecules, including metallophores. The fine isotope ratio data filtering step distinguished 34S/13C2 and 41K/13C2 features.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Analytical Chemistry

ISSN

0003-2700

e-ISSN

—

Svazek periodika

92

Číslo periodika v rámci svazku

10

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

6844-6849

Kód UT WoS článku

000537144800010

EID výsledku v databázi Scopus

—