Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Plant Nitrilase Homologues in Fungi: Phylogenetic and Functional Analysis with Focus on Nitrilases in Trametes versicolor and Agaricus bisporus

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F20%3A00532967" target="_blank" >RIV/61388971:_____/20:00532967 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68407700:21460/20:00348820

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.mdpi.com/1420-3049/25/17/3861" target="_blank" >https://www.mdpi.com/1420-3049/25/17/3861</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/molecules25173861" target="_blank" >10.3390/molecules25173861</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Plant Nitrilase Homologues in Fungi: Phylogenetic and Functional Analysis with Focus on Nitrilases in Trametes versicolor and Agaricus bisporus

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Fungi contain many plant-nitrilase (NLase) homologues according to database searches. In this study, enzymes NitTv1 fromTrametes versicolorand NitAb fromAgaricus bisporuswere purified and characterized as the representatives of this type of fungal NLase. Both enzymes were slightly more similar to NIT4 type than to NIT1/NIT2/NIT3 type of plant NLases in terms of their amino acid sequences. Expression of the synthetic genes inEscherichia coliOrigami B (DE3) was induced with 0.02 mM isopropyl beta-D-1-thiogalactopyranoside at 20 degrees C. Purification of NitTv1 and NitAb by cobalt affinity chromatography gave ca. 6.6 mg and 9.6 mg of protein per 100 mL of culture medium, respectively. Their activities were determined with 25 mM of nitriles in 50 mM Tris/HCl buffer, pH 8.0, at 30 degrees C. NitTv1 and NitAb transformed beta-cyano-L-alanine (beta-CA) with the highest specific activities (ca. 132 and 40 U mg(-1), respectively) similar to plant NLase NIT4. beta-CA was transformed into Asn and Asp as in NIT4 but at lower Asn:Asp ratios. The fungal NLases also exhibited significant activities for (aryl)aliphatic nitriles such as 3-phenylpropionitrile, cinnamonitrile and fumaronitrile (substrates of NLase NIT1). NitTv1 was more stable than NitAb (at pH 5-9 vs. pH 5-7). These NLases may participate in plant-fungus interactions by detoxifying plant nitriles and/or producing plant hormones. Their homology models elucidated the molecular interactions with various nitriles in their active sites.

  • Název v anglickém jazyce

    Plant Nitrilase Homologues in Fungi: Phylogenetic and Functional Analysis with Focus on Nitrilases in Trametes versicolor and Agaricus bisporus

  • Popis výsledku anglicky

    Fungi contain many plant-nitrilase (NLase) homologues according to database searches. In this study, enzymes NitTv1 fromTrametes versicolorand NitAb fromAgaricus bisporuswere purified and characterized as the representatives of this type of fungal NLase. Both enzymes were slightly more similar to NIT4 type than to NIT1/NIT2/NIT3 type of plant NLases in terms of their amino acid sequences. Expression of the synthetic genes inEscherichia coliOrigami B (DE3) was induced with 0.02 mM isopropyl beta-D-1-thiogalactopyranoside at 20 degrees C. Purification of NitTv1 and NitAb by cobalt affinity chromatography gave ca. 6.6 mg and 9.6 mg of protein per 100 mL of culture medium, respectively. Their activities were determined with 25 mM of nitriles in 50 mM Tris/HCl buffer, pH 8.0, at 30 degrees C. NitTv1 and NitAb transformed beta-cyano-L-alanine (beta-CA) with the highest specific activities (ca. 132 and 40 U mg(-1), respectively) similar to plant NLase NIT4. beta-CA was transformed into Asn and Asp as in NIT4 but at lower Asn:Asp ratios. The fungal NLases also exhibited significant activities for (aryl)aliphatic nitriles such as 3-phenylpropionitrile, cinnamonitrile and fumaronitrile (substrates of NLase NIT1). NitTv1 was more stable than NitAb (at pH 5-9 vs. pH 5-7). These NLases may participate in plant-fungus interactions by detoxifying plant nitriles and/or producing plant hormones. Their homology models elucidated the molecular interactions with various nitriles in their active sites.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Molecules

  • ISSN

    1420-3049

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    25

  • Číslo periodika v rámci svazku

    17

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    20

  • Strana od-do

    3861

  • Kód UT WoS článku

    000570398700001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85090004951