Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Selective Translation Complex Profiling Reveals Staged Initiation and Co-translational Assembly of Initiation Factor Complexes

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F20%3A00533104" target="_blank" >RIV/61388971:_____/20:00533104 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276520303890?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276520303890?via%3Dihub</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2020.06.004" target="_blank" >10.1016/j.molcel.2020.06.004</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Selective Translation Complex Profiling Reveals Staged Initiation and Co-translational Assembly of Initiation Factor Complexes

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Translational control targeting the initiation phase is central to the regulation of gene expression. Understanding all of its aspects requires substantial technological advancements. Here we modified yeast translation complex profile sequencing (TCP-seq), related to ribosome profiling, and adapted it for mammalian cells. Human TCP-seq, capable of capturing footprints of 40S subunits (40Ss) in addition to 80S ribosomes (80Ss), revealed that mammalian and yeast 40Ss distribute similarly across 5'TRs, indicating considerable evolutionary conservation. We further developed yeast and human selective TCP-seq (Sel-TCP-seq), enabling selection of 40Ss and 80Ss associated with immuno-targeted factors. Sel-TCP-seq demonstrated that eIF2 and eIF3 travel along 5' UTRs with scanning 40Ss to successively dissociate upon AUG recognition, notably, a proportion of eIF3 lingers on during the initial elongation cycles. Highlighting Sel-TCP-seq versatility, we also identified four initiating 48S conformational intermediates, provided novel insights into ATF4 and GCN4 mRNA translational control, and demonstrated co-translational assembly of initiation factor complexes.

  • Název v anglickém jazyce

    Selective Translation Complex Profiling Reveals Staged Initiation and Co-translational Assembly of Initiation Factor Complexes

  • Popis výsledku anglicky

    Translational control targeting the initiation phase is central to the regulation of gene expression. Understanding all of its aspects requires substantial technological advancements. Here we modified yeast translation complex profile sequencing (TCP-seq), related to ribosome profiling, and adapted it for mammalian cells. Human TCP-seq, capable of capturing footprints of 40S subunits (40Ss) in addition to 80S ribosomes (80Ss), revealed that mammalian and yeast 40Ss distribute similarly across 5'TRs, indicating considerable evolutionary conservation. We further developed yeast and human selective TCP-seq (Sel-TCP-seq), enabling selection of 40Ss and 80Ss associated with immuno-targeted factors. Sel-TCP-seq demonstrated that eIF2 and eIF3 travel along 5' UTRs with scanning 40Ss to successively dissociate upon AUG recognition, notably, a proportion of eIF3 lingers on during the initial elongation cycles. Highlighting Sel-TCP-seq versatility, we also identified four initiating 48S conformational intermediates, provided novel insights into ATF4 and GCN4 mRNA translational control, and demonstrated co-translational assembly of initiation factor complexes.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GX19-25821X" target="_blank" >GX19-25821X: Regulace translace v nemoci na globální i transcript-specifické úrovni.</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Molecular Cell

  • ISSN

    1097-2765

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    79

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

    546-560

  • Kód UT WoS článku

    000565182300005

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85087681454