ReDU: a framework to find and reanalyze public mass spectrometry data
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F20%3A00534785" target="_blank" >RIV/61388971:_____/20:00534785 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://www.nature.com/articles/s41592-020-0933-6#Sec29" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s41592-020-0933-6#Sec29</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41592-020-0916-7" target="_blank" >10.1038/s41592-020-0916-7</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
ReDU: a framework to find and reanalyze public mass spectrometry data
Popis výsledku v původním jazyce
We present ReDU (https://redu.ucsd.edu/), a system for metadata capture of public mass spectrometry-based metabolomics data, with validated controlled vocabularies. Systematic capture of knowledge enables the reanalysis of public data and/or co-analysis of one's own data. ReDU enables multiple types of analyses, including finding chemicals and associated metadata, comparing the shared and different chemicals between groups of samples, and metadata-filtered, repository-scale molecular networking.
Název v anglickém jazyce
ReDU: a framework to find and reanalyze public mass spectrometry data
Popis výsledku anglicky
We present ReDU (https://redu.ucsd.edu/), a system for metadata capture of public mass spectrometry-based metabolomics data, with validated controlled vocabularies. Systematic capture of knowledge enables the reanalysis of public data and/or co-analysis of one's own data. ReDU enables multiple types of analyses, including finding chemicals and associated metadata, comparing the shared and different chemicals between groups of samples, and metadata-filtered, repository-scale molecular networking.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10406 - Analytical chemistry
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Nature Methods
ISSN
1548-7091
e-ISSN
—
Svazek periodika
17
Číslo periodika v rámci svazku
9
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
901-904
Kód UT WoS článku
000560290600002
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85089870197