Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

rboAnalyzer webserver: web service for non-coding RNA characterization from NCBI BLAST output

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F21%3A00547237" target="_blank" >RIV/61388971:_____/21:00547237 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/37/17/2755/6125384?redirectedFrom=fulltext" target="_blank" >https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/37/17/2755/6125384?redirectedFrom=fulltext</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btab073" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btab073</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    rboAnalyzer webserver: web service for non-coding RNA characterization from NCBI BLAST output

  • Popis výsledku v původním jazyce

    A Summary: We present a web service for improving characterization of non-coding RNAs (ncRNAs) from NCBI BLAST outputs, based on a command-line application rboAnalyzer. Briefly, the application extends subject sequences of selected high scoring pairs (HSPs) in BLAST output to their plausible full length, and predicts their homology and secondary structures. The aim of the application is to aid to characterize subject RNAs in HSPs that come uncharacterized in BLAST output. The main advantages of the web-server are easy use and interactive analysis with search, filtering and data export options.

  • Název v anglickém jazyce

    rboAnalyzer webserver: web service for non-coding RNA characterization from NCBI BLAST output

  • Popis výsledku anglicky

    A Summary: We present a web service for improving characterization of non-coding RNAs (ncRNAs) from NCBI BLAST outputs, based on a command-line application rboAnalyzer. Briefly, the application extends subject sequences of selected high scoring pairs (HSPs) in BLAST output to their plausible full length, and predicts their homology and secondary structures. The aim of the application is to aid to characterize subject RNAs in HSPs that come uncharacterized in BLAST output. The main advantages of the web-server are easy use and interactive analysis with search, filtering and data export options.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Bioinformatics

  • ISSN

    1367-4803

  • e-ISSN

    1460-2059

  • Svazek periodika

    37

  • Číslo periodika v rámci svazku

    17

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    2

  • Strana od-do

    2755-2756

  • Kód UT WoS článku

    000697377500034

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85116466522