rboAnalyzer webserver: web service for non-coding RNA characterization from NCBI BLAST output
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F21%3A00547237" target="_blank" >RIV/61388971:_____/21:00547237 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/37/17/2755/6125384?redirectedFrom=fulltext" target="_blank" >https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/37/17/2755/6125384?redirectedFrom=fulltext</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btab073" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btab073</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
rboAnalyzer webserver: web service for non-coding RNA characterization from NCBI BLAST output
Popis výsledku v původním jazyce
A Summary: We present a web service for improving characterization of non-coding RNAs (ncRNAs) from NCBI BLAST outputs, based on a command-line application rboAnalyzer. Briefly, the application extends subject sequences of selected high scoring pairs (HSPs) in BLAST output to their plausible full length, and predicts their homology and secondary structures. The aim of the application is to aid to characterize subject RNAs in HSPs that come uncharacterized in BLAST output. The main advantages of the web-server are easy use and interactive analysis with search, filtering and data export options.
Název v anglickém jazyce
rboAnalyzer webserver: web service for non-coding RNA characterization from NCBI BLAST output
Popis výsledku anglicky
A Summary: We present a web service for improving characterization of non-coding RNAs (ncRNAs) from NCBI BLAST outputs, based on a command-line application rboAnalyzer. Briefly, the application extends subject sequences of selected high scoring pairs (HSPs) in BLAST output to their plausible full length, and predicts their homology and secondary structures. The aim of the application is to aid to characterize subject RNAs in HSPs that come uncharacterized in BLAST output. The main advantages of the web-server are easy use and interactive analysis with search, filtering and data export options.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2021
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Bioinformatics
ISSN
1367-4803
e-ISSN
1460-2059
Svazek periodika
37
Číslo periodika v rámci svazku
17
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
2
Strana od-do
2755-2756
Kód UT WoS článku
000697377500034
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85116466522