Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Determination of Butyrate Synthesis Capacity in Gut Microbiota: Quantification of but Gene Abundance by qPCR in Fecal Samples

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F21%3A00547738" target="_blank" >RIV/61388971:_____/21:00547738 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00023001:_____/21:00081564 RIV/00216208:11120/21:43922057 RIV/00216208:11110/21:10430624 RIV/00064173:_____/21:N0000200 a 2 dalších

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.mdpi.com/2218-273X/11/9/1303" target="_blank" >https://www.mdpi.com/2218-273X/11/9/1303</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/biom11091303" target="_blank" >10.3390/biom11091303</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Determination of Butyrate Synthesis Capacity in Gut Microbiota: Quantification of but Gene Abundance by qPCR in Fecal Samples

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Butyrate is formed in the gut during bacterial fermentation of dietary fiber and is attributed numerous beneficial effects on the host metabolism. We aimed to develop a method for the assessment of functional capacity of gut microbiota butyrate synthesis based on the qPCR quantification of bacterial gene coding butyryl-CoA:acetate CoA-transferase, the key enzyme of butyrate synthesis. In silico, we identified bacteria possessing but gene among human gut microbiota by searching but coding sequences in available databases. We designed and validated six sets of degenerate primers covering all selected bacteria, based on their phylogenetic nearness and sequence similarity, and developed a method for gene abundance normalization in human fecal DNA. We determined but gene abundance in fecal DNA of subjects with opposing dietary patterns and metabolic phenotypes-lean vegans (VG) and healthy obese omnivores (OB) with known fecal microbiota and metabolome composition. We found higher but gene copy number in VG compared with OB, in line with higher fecal butyrate content in VG group. We further found a positive correlation between the relative abundance of target bacterial genera identified by next-generation sequencing and groups of but gene-containing bacteria determined by specific primers. In conclusion, this approach represents a simple and feasible tool for estimation of microbial functional capacity.

  • Název v anglickém jazyce

    Determination of Butyrate Synthesis Capacity in Gut Microbiota: Quantification of but Gene Abundance by qPCR in Fecal Samples

  • Popis výsledku anglicky

    Butyrate is formed in the gut during bacterial fermentation of dietary fiber and is attributed numerous beneficial effects on the host metabolism. We aimed to develop a method for the assessment of functional capacity of gut microbiota butyrate synthesis based on the qPCR quantification of bacterial gene coding butyryl-CoA:acetate CoA-transferase, the key enzyme of butyrate synthesis. In silico, we identified bacteria possessing but gene among human gut microbiota by searching but coding sequences in available databases. We designed and validated six sets of degenerate primers covering all selected bacteria, based on their phylogenetic nearness and sequence similarity, and developed a method for gene abundance normalization in human fecal DNA. We determined but gene abundance in fecal DNA of subjects with opposing dietary patterns and metabolic phenotypes-lean vegans (VG) and healthy obese omnivores (OB) with known fecal microbiota and metabolome composition. We found higher but gene copy number in VG compared with OB, in line with higher fecal butyrate content in VG group. We further found a positive correlation between the relative abundance of target bacterial genera identified by next-generation sequencing and groups of but gene-containing bacteria determined by specific primers. In conclusion, this approach represents a simple and feasible tool for estimation of microbial functional capacity.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Biomolecules

  • ISSN

    2218-273X

  • e-ISSN

    2218-273X

  • Svazek periodika

    11

  • Číslo periodika v rámci svazku

    9

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    17

  • Strana od-do

    1303

  • Kód UT WoS článku

    000699344400001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85114111568