Molekulární kit pro časnou detekci kritických mikrobiálních kontaminant řasových kultur

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F22%3A00558737" target="_blank" >RIV/61388971:_____/22:00558737 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/68081707:_____/22:00558737 RIV/67985939:_____/22:00558737

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Molekulární kit pro časnou detekci kritických mikrobiálních kontaminant řasových kultur

Popis výsledku v původním jazyce

V rámci projektu BIOCIRTECH byl vytvořen molekulární kit pro včasnou detekcinmikrobiálních kontaminant řasových kultur. Cílem bylo získat vysoce citlivou metoduns relativně nízkou časovou náročností na provedení, proto byla zvolena metoda real-timenPCR (též kvantitativní neboli qPCR) s cílenou detekcí širokého spektra řasovýchnkontaminantů. Metodou lze detekovat buď širší skupiny kontaminantů (Chlorophyta,nSAR), nebo konkrétní nižší taxony (Chytridiomycota, Blastocladiomycota, Labyrintula,nRotifera, Euplaesiobystra, Chlorella). Kit je koncipován tak, aby byl využitelný univerzálněnpro řadu běžně kultivovaných mikrořas (Haematococcus, Chlorella, Phaeodactylum,nScenedesmus, Dunaliella) a aby byl modulární. V tomto ohledu výběr konkrétníchndetekčních reakcí spočívá na uživateli: může testovat všechny v kitu dostupnénkontaminanty, nebo si může vybrat jen určité reakce pro konkrétní skupinunpředpokládaných kontaminant.

Název v anglickém jazyce

Molecular kit for early detection of microbial contaminations in algae cultures.

Popis výsledku anglicky

During the implementation of the BICORTECH project, we developed a molecular kit providing early detection of microbial contaminants in algae cultivations. Our goal was to create a highly sensitive method with reasonable time demands. Therefore, we have optimized a set of real-time PCRs (quantitative PCR, qPCR) able to detect a variety of biological algae contaminants. With the kit, users can aim at the detection of a wider taxonomy group of contaminants (Chlorophyta, SAR) or, more particular, lower taxons (Chytridiomycota, Blastocladiomycota, Labyrintula, Rotifera, Euplaesiobystra, Chlorella). The kit was optimized for most universal use in several routinely cultivated microalgae (Haematococcus, Chlorella, Phaeodactylum, Scenedesmus, Dunaliella)as well as to be modular. To this end, users can choose the reaction set to be used: they can analyze their samples for all the potential contaminants available in the kit or they can choose any subset of the herein described reactions for particular contaminants.n

Druh

G_funk - Funkční vzorek

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/TN01000048" target="_blank" >TN01000048: Biorafinace jako oběhové technologie</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

TN01000048/3-V13

Číselná identifikace

TN01000048/3-V13

Technické parametry

Funkční vzorek spočívá v nově vyvinuté a optimalizované metodě PCR v reálném čase (qPCR) se sekvenčně specifickými sondami typu TaqMan. Celkem sedm sad specifických primerů a sond umožňuje senzitivní a specifickou detekci kritických kontaminant běžně kultivovaných mikrořas. Cílem detekce (amplifikace) je mnohakopiový gen 18S rDNA. Efektivita reakcí se pohybuje nejčastěji mezi 95 a 105 %, limit detekce je, s výjimkou dvou případů, mezi 6 a 200 molekulami v reakci. Byla vytvořena plazmidová kontrola izolace DNA s vlastní optimalizovanou reakcí.

Ekonomické parametry

Výrobek je použitelný v biotechnologických provozech jako prevence proti kontaminacím. Využitím se zvýší zajištění bezpečnosti a ochrany provozu.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

68081707

Název vlastníka

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

V - Výsledek je využíván vlastníkem

Požadavek na licenční poplatek

—

Adresa www stránky s výsledkem

—