Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Bacterial, but not fungal, communities show spatial heterogeneity in European beech (Fagus sylvatica L.) deadwood

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F23%3A00571650" target="_blank" >RIV/61388971:_____/23:00571650 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://academic.oup.com/femsec/article/99/4/fiad023/7076322?login=true" target="_blank" >https://academic.oup.com/femsec/article/99/4/fiad023/7076322?login=true</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/femsec/fiad023" target="_blank" >10.1093/femsec/fiad023</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Bacterial, but not fungal, communities show spatial heterogeneity in European beech (Fagus sylvatica L.) deadwood

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Deadwood decomposition and other environmental processes mediated by microbial communities are generally studied with composite sampling strategies, where deadwood is collected from multiple locations in a large volume, that produce an average microbial community. In this study, we used amplicon sequencing to compare fungal and bacterial communities sampled with either traditional, composite samples, or small, 1 cm(3) cylinders from a discrete location within decomposing European beech (Fagus sylvatica L.) tree trunks. We found that bacterial richness and evenness is lower in small samples when compared to composite samples. There was no significant difference in fungal alpha diversity between different sampling scales, suggesting that visually defined fungal domains are not restricted to a single species. Additionally, we found that composite sampling may obscure variation in community composition and this affects the understanding of microbial associations that are detected. For future experiments in environmental microbiology, we recommend that scale is explicitly considered as a factor and properly selected to correspond with the questions asked. Studies of microbial functions or associations may require samples to be collected at a finer scale than is currently practised.

  • Název v anglickém jazyce

    Bacterial, but not fungal, communities show spatial heterogeneity in European beech (Fagus sylvatica L.) deadwood

  • Popis výsledku anglicky

    Deadwood decomposition and other environmental processes mediated by microbial communities are generally studied with composite sampling strategies, where deadwood is collected from multiple locations in a large volume, that produce an average microbial community. In this study, we used amplicon sequencing to compare fungal and bacterial communities sampled with either traditional, composite samples, or small, 1 cm(3) cylinders from a discrete location within decomposing European beech (Fagus sylvatica L.) tree trunks. We found that bacterial richness and evenness is lower in small samples when compared to composite samples. There was no significant difference in fungal alpha diversity between different sampling scales, suggesting that visually defined fungal domains are not restricted to a single species. Additionally, we found that composite sampling may obscure variation in community composition and this affects the understanding of microbial associations that are detected. For future experiments in environmental microbiology, we recommend that scale is explicitly considered as a factor and properly selected to correspond with the questions asked. Studies of microbial functions or associations may require samples to be collected at a finer scale than is currently practised.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GC21-09334J" target="_blank" >GC21-09334J: Vliv mikroklimatu na rozklad mrtvého dřeva, mikrobiální diversitu a adaptační mechanismy s ohledem na důležité procesy lesního ekosystému</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    FEMS Microbiology Ecology

  • ISSN

    0168-6496

  • e-ISSN

    1574-6941

  • Svazek periodika

    99

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    8

  • Strana od-do

    fiad023

  • Kód UT WoS článku

    000961081100002

  • EID výsledku v databázi Scopus