Teoretický popis interakcí mezi imidazopyridopyrimidiny a guaninem
Popis výsledku
Byly diskutovány vlivy na stabilitu duplexů DNA obsahujících imidazopyridopyrimidiny, což jsou nové důležité motivy modifikované DNA. Na úrovni MP2/6-31G*(0.25) byly určeny interakční energie pro tvorbu vodíkových vazeb a pro případ stackingu mezi imidazopyridopyrimidiny a guaninem. Pro některé orientace byla velikost stackingové interakce srovnatelná se sílou vodíkových vazeb.
Klíčová slova
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Theoretical studies of interactions between imidazopyridopyrimidines and guanine
Popis výsledku v původním jazyce
The intrinsic contributions to the stabilization of imidazopyridopyrimidine-containing DNA duplexes, which are new, promising unnatural DNA motifs, were discussed. The MP2/6-31G*(0.25) interaction energies for the optimal HF/6-31G** hydrogen-bonding arrangements of the complexes between the respective imidazopyridopyrimidine derivatives and guanine covered the range from ?60.0 to ?101.7 kJ/mol. The MP2/6-31G*(0.25) stacking energies were investigated for a variety of vertical and angular orientations. For some of them, the stacking interaction was found to be competitive to the hydrogen-bonding.
Název v anglickém jazyce
Theoretical studies of interactions between imidazopyridopyrimidines and guanine
Popis výsledku anglicky
The intrinsic contributions to the stabilization of imidazopyridopyrimidine-containing DNA duplexes, which are new, promising unnatural DNA motifs, were discussed. The MP2/6-31G*(0.25) interaction energies for the optimal HF/6-31G** hydrogen-bonding arrangements of the complexes between the respective imidazopyridopyrimidine derivatives and guanine covered the range from ?60.0 to ?101.7 kJ/mol. The MP2/6-31G*(0.25) stacking energies were investigated for a variety of vertical and angular orientations. For some of them, the stacking interaction was found to be competitive to the hydrogen-bonding.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
CD - Makromolekulární chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
KJB400500602: Teorie stability a selektivity nepřirozených bází DNA
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2008
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Proceedings of the 9th WSEAS International Conference on Mathematics and Computers in Biology and Chemistry
ISBN
978-960-6766-75-6
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
—
Název nakladatele
Academia Romana
Místo vydání
Bucharest
Místo konání akce
Bucharest
Datum konání akce
24. 6. 2008
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
000258094800030
Základní informace
Druh výsledku
D - Stať ve sborníku
CEP
CD - Makromolekulární chemie
Rok uplatnění
2008