Fyzické mapování a funkční analýzy oblastí bohatých na geny krátkého ramene chromozómu 1 žita

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F07%3A00305898" target="_blank" >RIV/61389030:_____/07:00305898 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Development of SSR markers for the short arm of rye chromosome 1

Popis výsledku v původním jazyce

Simple sequence repeats (SSR) are DNA sequence stretches in which a short motif (1-6 bp) is tandemly repeated. SSR gain and lose repeat units at high rates through a mutational mechanism called "DNA replication slippage" (Ellegren 2004). Primer pairs used for PCR reaction are designed for the highly conserved regions flanking the SSR, which may amplify fragments of varying length in different individuals, even within populations. Due to their ease of application, codominance and hypervariability, microsatellites have become the marker of choice in such diverse fields like genotype-identification, construction of genetic maps, QTL analysis, population-genetic studies, marker assisted selection (MAS). The main disadvantage of SSR-markers is the requiredamount of labor and the high cost for their development. A recent review from Squirell et al. (2003) estimated the necessary effort to develop ten polymorphic SSR-markers: one hundred sequenced clones and thirty tested primer pairs. These

Název v anglickém jazyce

Development of SSR markers for the short arm of rye chromosome 1

Popis výsledku anglicky

Simple sequence repeats (SSR) are DNA sequence stretches in which a short motif (1-6 bp) is tandemly repeated. SSR gain and lose repeat units at high rates through a mutational mechanism called "DNA replication slippage" (Ellegren 2004). Primer pairs used for PCR reaction are designed for the highly conserved regions flanking the SSR, which may amplify fragments of varying length in different individuals, even within populations. Due to their ease of application, codominance and hypervariability, microsatellites have become the marker of choice in such diverse fields like genotype-identification, construction of genetic maps, QTL analysis, population-genetic studies, marker assisted selection (MAS). The main disadvantage of SSR-markers is the requiredamount of labor and the high cost for their development. A recent review from Squirell et al. (2003) estimated the necessary effort to develop ten polymorphic SSR-markers: one hundred sequenced clones and thirty tested primer pairs. These

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

GE - Šlechtění rostlin

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA521%2F04%2F0607" target="_blank" >GA521/04/0607: Fyzické mapování a funkční analýzy oblastí bohatých na geny krátkého ramene chromozómu 1 žita (1RS)</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju

Rok uplatnění

2007

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Vorträge für Pflanzenzüchtung

ISSN

0723-7812

e-ISSN

—

Svazek periodika

71

Číslo periodika v rámci svazku

-

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

279-281

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—